LINC01355对非小细胞肺癌细胞生物学行为的影响

来源 :南昌大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:qisini7814
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背景与目的:长链非编码RNA(Lnc RNA)可作为基因表达过程的主要调节剂,在体内可以影响肿瘤细胞增殖,迁移等生物学行为。研究表明LINC01355对乳腺癌及口腔鳞癌的发生发展产生一定的影响,但目前尚未有LINC01355在肺癌中的研究报道,本研究通过对TCGA,GEO数据库中的肺癌数据进行研究并探讨LINC01355在肺癌中可能的作用机制,再通过细胞相关实验进一步验证LINC01355在肺癌细胞系中的表达水平及其对肺癌细胞生物学行为的影响。方法:从TCGA及GEO数据库下载肺腺癌及鳞癌组织和相应的正常组织的表达数据、临床信息等。通过生物信息学的方法比较LINC01355在肺癌组织和正常组织的表达差异,同时以LINC01355的表达量将肿瘤样本分为高低表达组,再进行差异基因筛选,其次通过GO,KEGG富集分析以及ss GSEA免疫浸润分析来探索其LINC01355对肺癌可能的发病机制。最后采用q RT-PCR检测肺癌细胞中LINC01355的表达情况,并通过MTT,细胞克隆,伤口愈合以及Transwell实验进一步验证LINC01355对肺癌细胞增殖和侵袭能力是否产生影响。结果:1、通过生物信息分析的研究发现LINC01355在肺癌组织中表达水平升高;随后用R分析了GSE19188、GSE4824数据集,结果显示了肺癌组织及肺癌相关细胞系中LINC01355表达量升高。利用R中的“Edger”包进行差异基因分析,共筛选出331个差异基因进行GO及KEGG富集分析结果显LINC01355可能参与多种信号通路来调节生物学过程。免疫浸润结果提示免疫细胞浸润程度与LINC01355的表达量成负相关。2、与正常的肺支气管上皮细胞相比,LINC01355在肺癌细胞株中表达上调。随后的MTT实验和细胞克隆实验显示在干扰LINC01355的表达后肺癌细胞的增殖能力受到明显抑制;而细胞划痕,Transwell的实验结果显示,干扰LINC01355的表达会抑制肺癌细胞的迁移和侵袭能力。结论:通过对TCGA,GEO中样本的数据分析,结果显示了LINC01355在肺癌组织和细胞系中均表达上调,沉默LINC01355在肺癌细胞中的表达能够抑制肺癌细胞的增殖和侵袭能力。这些都表明LINC01355在肺癌中可以促进肿瘤的进展,是潜在的肺癌诊断标志物及治疗靶点标。
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