辣椒MYB转录因子基因的克隆及表达分析

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辣椒素是辣椒属植物特有的次生代谢,是物辣椒素类物质中的主要组成部分,也是辣椒辛辣味道的主要来源。众多研究表明辣椒素在新型农药、镇痛、抗疲劳、抗肿瘤、美容、抗菌等领域具有重要的作用,因此研究辣椒素的合成途径调控机制具有重要意义。辣椒素是由苯丙氨酸途径合成的香草基胺和由支链脂肪酸途径合成的8-甲基-6-癸烯酰经辣椒素合成酶(CS)催化缩合而成。CS基因启动子含有TATA-box、CAAT-box、W-box、GATA-box、ABRE、TCA-element等多个顺式作用元件,以及包含一个能够与MYB转录因子结合的结合位点(CAACTG)。因此可以推测,MYB转录因子可以通过与CS启动子序列中的MYB结合位点结合,产生互作,激活或者抑制辣椒素合成酶基因(CS)的表达,影响辣椒素合成途径,最终影响了辣椒素的合成。本研究通过PCR技术在黄灯笼椒中获得一个MYB转录因子基因,命名为Ccmyb,全长1038bp,编码345个氨基酸。经过网站预测分析,Ccmyb包含有两个螺旋-转角-螺旋机构的MYB转录因子结构域,属于R2R3-MYB转录因子家族。经过同源性分析发现与Lycopersicon esculentum Mill(番茄)和Solanum pennellii(野生种潘那利番茄)转录因子MYB44-like同源关系比较近。利用http://web.expasy.org网站对Ccmyb的蛋白进行分析,可知pI为8.57,Mw为38241.06,是一类定位在细胞核中的蛋白,无跨膜组织。利用RT-PCR技术分析了Ccmyb基因与3个辣椒素合成相关基因基因(Pun1,PAL,KAS)在黄灯笼椒根、茎、叶、花、果实、种子、胎座以及坐果期、绿熟期、转色期、成熟期的果实的表达情况。发现Ccmyb基因在种子中的表达量最高,在花中表达量最低。而在不同发育时期的果实中转色期中表达量最高;Pun1在种子中表达量最高,在花中表达量最低,不同发育时期的果实中在绿熟期表达量最高;KAS在叶中表达量最高,在花中表达量最低,不同发育时期的果实中在转色期中表达量最高;PAL在根中表达量最高,在花中表达量最高,不同发育时期的果实中在坐果期表达量最高;Pun1作为编码酰基转移酶基因(AT3),是辣椒素合成酶(CS)的基因,对辣椒素合成途径具有重要的调控作用,而Ccmyb基因与Pun1基因在不同组织和果实中表达趋势基本一致,因此可以推测Ccmyb基因对辣椒素合成途径有调控作用。
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