目前,我国正处于突发性公共卫生事件的高发期,由于这些事件传播速度快、影响范围广,处置是否及时、妥善,将直接影响到社会的安定与国家安全。这也是对政府工作的一场“大考”。国家审计在突发性公卫事件中发挥的“免疫系统”功能,为我国经济社会的正常运转提供了坚实的保障。在政府应对过程中,国家审计部门要加强对经济问题的关注,及时发现和跟踪专项救灾资金、社会捐赠款物的安全问题、严重违法违纪问题,发现和排查工作中的薄弱环节和潜在风险,以避免新问题进一步发展为趋势性问题、局部问题进一步发展为整体性问题,提高工作效率。因此,对突发性公共卫生事件应急审计的探讨不仅具有理论价值,而且具有重要的现实意义。本文结合当前我国突发性公共卫生事件的实际情况,基于新冠肺炎疫情应急审计相关案例,总结提出了审计过程中出现的一些问题,并对其成因进行了分析探讨,据此提出相应的对策建议。具体展开来说,先从理论上对突发性公共卫生事件应急审计的基本原理进行了分析,概括出突发性公共卫生事件的特点、工作理念和意义,为后面的研究做理论上的铺垫。其次,以H市疫情防控应急审计为例,就审计取证存在一定难度、审计人员的综合素质不足、财政资金审计基础薄弱、审计结果运用不够等几个方面进行论述,阐明了当前我国突发性公共卫生事件审计中存在一些问题的现状,研究了出现这些问题的原因,最后针对如何有效解决这些问题制定了可行性措施,使政府部门能够以更高的质量和效率完成突发性公共卫生事件应急响应工作。