港珠澳大桥是一国两制背景下,广东省与香港、澳门特区政府首次共同建设与管理的跨境重大交通基础设施,创设性地采用了设立非营利事业单位作为项目法人的合作模式。港珠澳大桥管理局承担着项目建设、运营、管理等事务的公共管理职能,事业单位不仅体现了三地政府在项目中发挥的积极作用,符合粤港澳大桥作为政府还贷公路的非营利性要求,同时又借鉴了香港法定机构模式进行制度创新,采用法人治理模式,引进企业管理方式,具有企业性与公共性相结合的特点。但港珠澳大桥管理局与其他事业单位一样,均是高度集权式的行政管理体制的产物,继承了我国事业单位固有的弊端。仍然套用政府的科层制组织形式,具有行政级别,其决策、执行与监督机制仍然比较僵化。政府参与程度较高,其主管部门可能通过行政命令、财务控制或者人事任免等手段直接领导或控制管理局,导致管理局缺乏必要的自主性从而影响公共服务的质量和项目运营的效率。另外,管理局作为我国第一个内地与境外政府共同设立的事业单位,其设立的依据性文件即三地协议法律性质不明确且无强制执行的效力,项目中出现争议时只能协商、无法协商时由三地委决定或专责小组最终裁决而不能请求司法救济,这种决策方式具有一定程度上的政治色彩,存在着我国法律框架下无法解决的局限性。日本及台湾地区行政法人制度为管理局的组织设计提供了新途径,本文在大陆法系公法人制度的基础上,探讨行政法人制度对管理局发展方向的借鉴,促进事业单位向事业法人转变,保障项目法人的独立性与自主性,并建立绩效考核与监督制度,提高项目法人公共服务的质量与实现对管理局的有效监督,保证公共行政任务与目标的高效完成。