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黄连上清丸（Huanglian Shangqing Pills）是我国常用的一种中成药，生产厂家众多，获准的品种规格多达两百余种。中药制剂，尤其是多厂家的中药复方制剂，常因药材产地、辅料、生产工艺、生产状态等不同使其总体质量差异较大，成为中药制剂发展的一个主要制约因素。因此，有必要对黄连上清丸的总体质量差异进行分析及控制。黄连上清丸的质量控制方法有薄层色谱法（thin layerchromatography, TLC）和高效液相色谱法（high performance liquidchromatography, HPLC）等，上述方法的不足之处在于样品处理复杂、破坏样品和使用化学试剂等。近红外光谱法（near infrared spectroscopy,NIRS）结合化学计量学技术（chemometric techniques），能够在特征谱段甚至全光谱范围内找出并提取被众多共性所掩盖的微弱特性信息，建立充分反映光谱特征与待测特性之间关系的数学模型，实现复杂体系的高通量、快速及无损分析。本研究采用近红外漫反射光谱法（near infrared diffuse reflectancespectroscopy, NIRDRS）结合判别分析（discriminant analysis, DA）、主成分分析（principal component analysis, PCA）和广义方差分析（generalized variance analysis, GVA），建立黄连上清丸制剂类型间、厂间和批间总体质量差异的高通量分析方法。目的：建立黄连上清丸制剂类型间、厂间和批间总体质量差异的近红外漫反射光谱高通量分析方法。方法：1.测量黄连上清丸样品近红外漫反射光谱。2.建立黄连上清丸总体质量差异分析方法：（1）建立黄连上清丸制剂类型间总体质量差异的判别分析模型，采用校正集、验证集和留一法交叉验证的正判率对模型进行评价。以广义方差分析量化表征黄连上清丸制剂类型间总体质量差异。（2）建立黄连上清丸厂间总体质量差异的判别分析模型，采用校正集、验证集和留一法交叉验证的正判率对模型进行评价。以广义方差分析量化表征黄连上清丸厂间总体质量差异。（3）以主成分分析建立黄连上清丸批间总体质量差异的定性分析模型。以广义方差分析量化表征黄连上清丸批间总体质量差异。结果：1.近红外光谱判别分析能够准确、直观地识别黄连上清丸的不同制剂类型，表明不同制剂类型的黄连上清丸存在质量差异；近红外光谱广义方差分析能够量化表征黄连上清丸不同制剂类型间的总体质量差异大小。2.近红外光谱判别分析能够准确、直观地识别黄连上清丸的不同厂家，表明不同厂家的黄连上清丸存在质量差异；近红外光谱广义方差分析能够量化表征黄连上清丸不同厂家间的总体质量差异大小。3.近红外光谱主成分分析能够直观表征黄连上清丸的批间总体质量差异；近红外光谱广义方差分析能够量化表征黄连上清丸的批间总体质量差异大小。结论：本研究将近红外漫反射光谱法与化学计量学技术相结合，能够同时定性、定量分析黄连上清丸制剂类型间、厂间和批间的总体质量差异，实现了黄连上清丸总体质量差异的高通量分析。