外周血环状RNA在系统性红斑狼疮肾损害患者中的差异表达及其诊断价值研究

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研究背景:系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种病因不明的,以自身免疫性炎症为突出表现的系统性自身免疫病,血清中出现以抗核抗体为代表的多种自身抗体和多器官受累是其两个主要临床特征。SLE肾损害(SLE patients with renal involvement,SLE+RI)是指患者在SLE的基础上合并肾脏的免疫性损害,同时伴有肾脏损害临床表现的一种疾病。高达70%的SLE患者可出现肾脏受累,其中约10-30%的SLE肾受累患者将发展为肾衰竭,然而SLE患者早期的肾损害症状常较隐匿,而一旦发展为肾衰竭则无法逆转,因此SLE相关肾损害的早期诊断意义重大。环状RNA(circular RNA,CircRNA)是一种具有闭合环状结构的非编码RNA,具有发育阶段和组织特异性。由于没有5’或3’末端,circRNA能够抵抗RNase消化,因而比大多数线性RNA稳定。越来越多的研究表明,circRNAs不仅参与许多疾病的进展,例如癌症,阿尔兹海默症,自身免疫性疾病,心血管疾病等,而且还可以用作疾病的诊断和治疗预后分子生物标志物。然而,目前对于circRNA在SLE肾损害患者外周血中的作用仍鲜见报道。研究目的:筛选并鉴定SLE+RI患者全血中差异表达的circRNA,探讨差异表达的circRNA在SLE+RI诊断及预后评估中的价值,以期为SLE肾损害患者的诊疗提供新的有价值的生物标志物。研究方法:分别选择3例SLE肾损害患者、3例SLE无肾损害患者(SLE patients without renal involvement,SLE-RI)和 3 例健康对照者(healthy control,HC),采用circRNA芯片技术对这些研究对象外周血全血标本中的circRNA的表达谱进行检测和比较。选择在SLE+RI中显著上调表达的部分circRNA作为候选分子,采用实时定量RT-PCR技术在一组包含SLE+RI、SLE-RI、HC、无SLE的肾炎患者(neprhritis without SLE,NWS)和类风湿性关节炎患者(rheumatoid arthritis,RA)的独立样本中进行差异表达的鉴定。在此基础上,通过受试者工作特征(ROC)曲线评估候选circRNA对诊断SLE肾损害的敏感性和特异性。此外,通过对初诊SLE肾损害患者进行临床随访,比较治疗前后候选circRNA的水平变化,评估候选circRNA在监测SLE+RI治疗效果中的价值。最后,通过采用miRanda软件与miRNA响应元件(MRE)进行比对分析,对验证结果显示有潜在诊断价值的circRNA分子的潜在miRNA靶标进行预测。研究结果:1、CircRNA芯片检测结果显示,与HC组相比,SLE-RI组中有4235个circRNAs有表达差异(其中2197个被上调),SLE+RI组1566个circRNAs有表达差异(其中753个被上调)。与SLE-RI组相比,SLE+RI组有828个circRNA存在差异表达(其中234个上调)。2、qRT-PCR验证芯片结果:根据芯片检测结果,本研究选择了 11条在SLE+RI组中上调表达最显著的circRNAs分子(同时与SLE-RI和HC组比较)作为候选 circRNA(包括:hsacirc0046995,hsacirc0082626,hsacirc0082689,hsacirc0082688,hsacirc0001093,hsacirc0002715,hsacirc0004156,hsacirc0031482,hsacirc0022383,hsacirc0008675 和 hsacirc0027070),对来自77个SLE患者(37个SLE+RI患者和40个SLE-RI患者)和33个HC的外周血标本进行的qRT-PCR检测结果显示,SLE患者外周血中hsacirc0082626,hsacirc0082689,hsacirc0082688,hsacirc0002715,hsacirc0004156,hsacirc0008675的平均表达水平明显高于HC,与芯片检测结果一致。同时SLE+RI 患者外周血中 hsacirc0082688,hsacirc0082689 和 hsacirc0008675的水平显著高于 SLE-RI 患者和 HC,而 hsacirc0004156,hsacirc0002715 和hsacirc0082626的表达水平在SLE+RI患者和SLE-RI患者之间没有显著差异。3、与其相关疾病的鉴别结果:本部分研究收集了 38例RA患者和24例NWS患者的外周血标本,通过qRT-PCR技术检测了外周血hsacirc0082688,hsacirc0082689 和 hsacirc0008675 在 SLE+RI 患者,RA 患者和 NWS 患者之间的表达差异。结果显示SLE+RI患者外周血中hsacirc0082689,hsacirc0082688和hsacirc0008675的表达水平显著高于RA患者和NWS患者。4、相关性分析结果显示,SLE+RI患者外周血中hsa circ 0082688,hsacirc0082689 和 hsacirc0008675 的水平与血清 C4、抗 dsDNA 和抗核小体抗体的水平相关,且hsacirc0008675的水平与血清C3的水平相关。同时,hsacirc0082688和hsacirc0008675在SLE+RI患者外周血中的表达水平与治疗有相关性。5、ROC曲线分析表明,与对照组相比(包括初诊SLE-RI患者,RA患者,NWS 患者和 HC),hsacirc0082688 联合 hsacirc0008675 在诊断初诊 SLE+RI患者的曲线下面积可达0.925,敏感度和特异度分别为79.17%和96.64%。6、CircRNA潜在miRNA靶标的预测结果:miRanda软件与MRE的分析结果显示,hsa-miR-5003-3p,hsa-miR-4277,hsa-miR-506-3p 和 hsa-miR-4298 可能是 hsacircRNA0082689 和 hsacircRNA0082688 的共同潜在靶标。另外,hsa-miR-3192-3p 和 hsa-miR-5579-5p 可能分别为 hsacircRNA0082689 和hsacircRNA0082688 的潜在靶标。此外,hsacircRNA0008675 可能结合hsa-miR-3074-5p,hsa-miR-6875-5p,hsa-miR-5001-5p,hsa-miR-5581-5p 和 hsa-miR-6842-3p。研究结论:1、SLE肾损害患者全血中有大量circRNA分子的表达发生显著变化,提示circRNA可能在SLE肾损害患者的疾病发生发展中发挥作用。2、外周血hsacirc0082688和hsacirc0008675的表达水平在SLE肾损害患者中显著上调,可有效区分SLE-RI、RA、NWS患者和HC,有望成为SLE+RI诊断和治疗效果监测的潜在生物标志物。
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