目的:研究原发性根尖周感染根管内牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.gingivalis)rgpA基因型和fimA基因型的分布情况,分析rgpA和fimA基因型及其组合与根尖周感染临床症状的相关性。方法:临床收集141例原发性根尖周感染根管内细菌样本,抽提DNA,PCR检测P.gingivalis的16S rRNA基因,统计P.gingivalis检出率。在P.gingivalis阳性样本中,运用fimA基因引物特异性PCR法检测各样本P.gingivalis的fimA基因型分布;PCR扩增P.gingivalis rgpA基因片段,根据限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,通过AvaI酶切PCR产物检测P.gingivalis的rgpA基因型分布。运用Pearsonχ~2检验分析rgpA和fimA基因型及其组合与根尖周感染临床症状的相关性。结果:141例原发性根尖周感染根管内共检出76例P.gingivalis阳性样本,检出率53.9%,rgpA检出51例,检出率67.1%,其中Ⅰ型25例(49%),Ⅱ型26例(51%);fimA共检出62例,检出率81.6%,以Ⅱ型检出20例(32.3%)和Ⅳ型检出14例(22.6%)居多。rgpA:fimA基因型组合检出46例,较常见的组合为rgpAⅡ:fimAⅡ型检出9例(19.6%),rgpAⅠ:fimAⅡ型检出8例(17.4%)。统计学分析发现fimAⅠ+Ⅰb型与疼痛的发生显著相关;在基因型组合中,rgpAⅡ:fimAⅠ+Ⅰb型比rgpAⅠ:fimAⅠ+Ⅰb型更易引起疼痛。结论:原发性根尖周感染根管内P.gingivalis的rgpA基因和fimA基因存在多态性,fimAⅠ+Ⅰb型与疼痛的发生显著相关。