自2014年预算法修订以来,全额事业单位通过不断完善制度并积极践行,一套较为完善的预算管理体系已经初步建立。在预算的编制、审批、执行等各个环节也有了很大程度的提高。2016年国家又开展内部控制制度建立与评估工作,并将内部控制作为事业单位的重要制度。预算单位要成为一个好的预算主体,就必须提高对内部控制建设的重视程度,严格按照法律制度规定的程序执行,努力提高预算的执行质量和效率。但不容乐观的是,目前国内大部分事业单位没有形成系统性的内控管理体系,管理制度不完善,碎片化管理现象普遍,对提高内控的有效性不利,影响了预算执行的效果。因此,将全面预算管理的各项考核目标与内部控制制度有机地融合,并且使得全面预算管理和内部控制制度在工作内容和程序上相辅相成,高效运行起来,是目前我国事业单位在财务管理乃至单位整体运行层面需要认真思考的问题。本文首先整理了当前国内外预算管理和内部控制的研究现状。接着从基本概念入手,介绍了预算管理、内部控制的相关概念和理论,并就两者的关系进行了简单分析。然后选择A全额事业单位作为样本,对单位的基本情况进行了介绍,并基于全面预算管理对A全额事业单位的内部控制现状进行了评价。最后参考新《预算法》以及《行政事业单位内部控制规范(试行)》,将预算管理与内部控制有机融合起来,构建出基于预算管理的内部控制评价指标体系。运用模糊综合评价法,选择5位专家对A全额事业单位各项指标进行评价打分,对A全额事业单位的内部控制进行了实证研究。实证分析结果表明,A全额事业单位内控水平良好,但也存在一些问题,主要表现在预算考核、预算人员专业胜任能力、预算编制范围、部门之间沟通协调等方面。基于上述问题,本文最后对如何提升A全额事业单位内部控制水平提出五点建议:一是加强内控及预算管理的宣传培训,强化预算管理意识;二是完善预算考核奖惩制度,评估预算管理效果;三是拓宽预算管理范围,实施全面预算;四是进一步加强部门间沟通协调,提高预算工作效率;五是结合内控规范要求,科学化预算编制方法。