随着社会的发展和经济水平的提高,人们越来越关注自身的健康问题。更多的科研人员开始关注健康领域的数据处理。健康领域的数据比起其他行业,它显得更为庞杂,包括很多结构化数据和半结构化数据。现阶段,健康领域的数据主要还是以医疗机构的数据为主,大量的数据存储在关系型数据库和XML文档中。由于数据呈现出很强的异构性,健康领域形成了大量的信息孤岛。数据在于利用,对于健康领域异构数据的查询,开发人员需要将更多的注意力用在获取数据的方法上,浪费了大量的时间和精力。为了解决这一问题,本文提出建立健康领域异构数据查询系统,解决异构数据的统一查询问题,使得开发人员可以将更多的精力用于数据的使用,节省了开发人员的时间和开发的成本。首先,本文设计健康领域异构数据查询系统的架构,选用中介器-包装器方式进行实现,选用XML Schema作为统一的公共数据模型,选用XQuery作为统一查询语言。系统主要实现数据源注册,模式抽取与转换,模式集成,查询分解四个模块。其次,针对传统的利用手工配置的方式完成模式集成的不足,本文研究了基于XML Schema的语义相似度计算和结构相似度计算,同时定义了模式集成中的三种类型的结构冲突检测和解决方案,完成模式集成工作,生成模式映射文件,大大简化了模式集成的开发工作。针对全局模式重建过程中的结构冲突检测,结合XML Schema的树状结构特性,给出了关系嵌套冲突,关系方向冲突和实体属性冲突的定义,使用树节点之间的路径长度进行结构冲突的检测,进一步降低全局模式中的冗余,完成了本系统中模式集成功能。最后,本文在模式映射文件的基础上,使用XQuery的查询分解算法,实现了XQuery全局查询语句的分解,完成了健康领域关系型数据和XML文档数据的统一查询工作,为业务的开发提供了便利。