低碳经济以其低能耗、低排放、低污染的特点迅速受到各国认可，低碳经济已经成为一种趋势。建立在低碳经济基础上的碳关税，得到了发达国家的青睐。发达国家积极酝酿开征碳关税，借碳关税之名来实行贸易保护。在我国服务贸易分类中，运输服务贸易作为第二大服务贸易部门，并且作为货物贸易发展的运输载体，在我国对外贸易中有着举足轻重的作用。因而，在低碳经济和碳关税大背景下，研究运输服务贸易中碳关税的负效应，构建我国运输服务贸易碳关税的应对机制显得尤为重要。本文首先介绍了运输服务贸易和碳关税有关的概念，然后总结分析了碳关税和应对机制的基础理论，重点分析了外部性理论、产权理论、庇古税理论、生态补偿理论，并分析总结了碳关税的特点、本质，提出历程等内容，形成了较为系统的碳关税理论体系。在介绍理论及我国运输服务贸易发展现状基础上，运用局部均衡分析法构建模型从理论上分析了运输服务贸易中碳关税的贸易限制效应、贸易转移效应、贸易条件效应、社会福利效应、产品及市场连锁效应和产业安全效应等碳关税的负效应，为实证分析和应对机制的构建奠定了理论基础。在上文碳关税负效应局部均衡分析的基础上，运用投入产出模型对我国运输服务贸易中海运运输服务贸易、航空运输服务贸易、其他运输服务贸易出口隐含碳排放量进行了测算，之后基于运输服务贸易中出口隐含碳排放量，分析了碳关税在10美元每吨至60美元每吨时我国运输服务贸易下的海运服务贸易、航空运输服务贸易、其他运输服务贸易出口成本的影响。构建了计量经济模型，采用了ADF检验法、Johansen协整检验、格兰杰因果检验等计量方法，将我国运输服务贸易出口额和运输服务业碳排放量进行了回归分析，通过分析和检验得知运输服务贸易的出口总额对我国运输服务行业碳排放总量的解释程度很大，即运输服务贸易出口额的大小与运输服务业总体碳排量的大小有着密切的联系，一旦发达国家开征碳关税，我国运输服务贸易出口额将会受到不利影响。之后从欧盟开征航空碳关税的视角出发，运用引力模型对欧盟航空碳关税对我国航空客运服务贸易出口的影响进行了实证分析，得知欧盟征收航空碳关税会对我国的航空客运服务贸易的出口造成不利影响。在运输服务贸易碳关税应对机制方面，文章以机制设计理论为基础，设计了我国运输服务贸易中碳关税应对的激励机制。在该激励机制中主要有政府和企业参与，社会监督，形成了三位一体的运输服务贸易中碳关税应对的激励机制。并从政府和企业两个层面提出了碳关税应对机制的措施。政府应从产业、法律法规、技术和市场方面构建应对机制，企业层面则要加大低碳技术创新，加强企业碳减排意识，实施市场多元化战略，熟悉与环境保护相关的国际贸易案例与规则等来积极应对碳关税，实现我国运输服务贸易绿色健康可持续发展。