猪LPL基因cDNA的克隆、多态性和表达谱分析

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脂蛋白脂酶(Lipoprotein Lipase,LPL)是一种多功能蛋白,能够催化乳糜微粒和极低密度脂肪酸的甘油三酯水解,调节脂肪代谢,促进脂蛋白被细胞结合和吸收,是影响脂肪沉积的关键酶之一。本研究利用RT-PCR方法克隆纯种大白猪LPL基因的编码区序列;利用生物信息学方法预测其结构和功能域;并以野猪、民猪、大白猪、长白猪、杜洛克为研究对象,利用PCR-SSCP方法检测其多态性,探讨不同基因型在种间的分布规律;利用Real-time PCR方法研究其组织表达谱,主要研究结果如下:1.克隆测序了大白猪LPL基因的全长编码区,预期编码478个氨基酸。利用生物信息学方法预测了猪LPL基因的结构与功能域;分析了不同物种LPL基因的同源性,构建了分子进化树。2.在外显子5上检测到3个SNPs位点,在外显子10上检测到一处碱基置换和一处碱基插入/缺失突变。群体遗传学分析表明,各基因型在5个猪种中的分布存在着极显著的差异(p<0.01)。3.构建了民猪(180日龄)LPL基因的组织表达谱,结果表明LPL基因在心脏、肝脏、胃、脾、肾、肺、大肠、小肠、子宫、卵巢、背肌、腿肌、脂肪等13个组织中都表达,但相对表达量存在组织差异,心脏、背肌、腿肌、脂肪组织中的表达量较高,子宫和卵巢组织表达量较低。
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