染色体微阵列分析技术在先天性心脏病婴幼儿中的遗传病因学研究

来源 :广州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jeego
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:  1.探讨染色体微阵列分析技术(chromosomal microarray analysis,CMA)在先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)婴幼儿中,进行遗传病因学研究的价值。  2.探讨CHD不同分组致病性拷贝数变异(copy number variants,CNVs)检出率的差异性。  3.探讨使用CMA检测染色体微缺失/微重复与CHD的相关性。  4.为CMA技术在CHD且染色体核型正常婴幼儿中,作为常规检测方法提供理论依据。  方法:  1.选取2013年1月至2014年12月在广州市妇女儿童医疗中心诊断为CHD且染色体核型结果正常的106例婴幼儿纳入研究。  2.抽取所有患儿外周血,使用Qiagen DNA提取试剂盒提取胎儿样本DNA,并使用NanoDrop分光光度计对DNA的浓度和纯度进行测量。  3.根据Affymetrix公司提供的标准实验操作流程对样本DNA进行消化、连接、扩增、纯化、片段化、标记信号、杂交及洗涤、染色与扫描芯片操作。  4.使用CHAS软件对扫描芯片产生的CEL.文件进行分析。  5.根据本实验室的内部参考数据库和DGV、DECIPHER、OMIM、UCSC Genome Browse,CHD wiki及PUBMED等在线外部数据库对CHAS软件分析产生的拷贝数变异进行比对分析,判断所检测出的CNV性质。  结果:  1.106例患儿经CMA检测,拷贝数变异(copy number variants,CNVs)的检出率为96.3%(102/106),所检测片段大小范围为102kb到13.8Mb之间。其中,良性CNVs的检出率为68.9%(73/106),致病性CNVs的检出率为28.3%(30/106),VOUS的检出率为2.8%(3/106)。  2.单一类型CHD和复合类型CHD的致病性CNVs检出率分别为31.7%(20/63)和23.3%(10/43),两者之间无统计学意义(P>0.05)。在不同CHD类型分类中,致病性CNVs的检出率分别为:隔膜缺损23.3%(10/43);房室间隔缺损0(0/3);圆锥动脉干缺损12.5%(2/16);左室流出道梗阻35.7%(5/14);右室流出道梗阻45.5%(5/11);左室流出道梗阻+右室流出道梗阻75%(3/4);单心室0(0/1);以及其他类型35.7%(5/14),包括动脉导管未闭33.3%(4/12)和先天性肥厚型心肌病50%(1/2)。  3.孤立型CHD、CHD合并心外结构异常、CHD合并精神发育迟滞/生长发育迟缓,以及CHD合并心外结构异常+精神发育迟滞/生长发育迟缓4组中,致病性CNVs的检出率分别为19.5%(8/41),20%(5/25),63.2%(12/19)和23.8%(5/21)。其中CHD合并精神发育迟滞/生长发育迟缓婴幼儿组中致病性CNVs的检出率明显高于孤立型CHD婴幼儿组(63.2%与19.5%,P=0.001)及CHD合并心外结构异常婴幼儿组(63.2%与20%,P=0.004)。  4.30例患儿的CMA结果为致病性CNVs,包括22q11微缺失综合征(n=6),22q11微重复综合征(n=1),Williams-Beuren综合征(n=6),Angleman综合征(n=1),Wolf-Hirschhorn综合征(n=2),Schinzel-Giedion综合征(n=1),15q24微缺失综合征(n=1),1p36微缺失综合征(n=1),Cornelia de Lange综合征(n=1),马凡综合症(n=1),Opitz G/BBB综合征(n=1),6q24LOH(n=1),以及CNVs覆盖DECIPHER、ISCA数据库已知致病片段(n=7)。  5.30例检出有致病性CNVs的患儿中,80%(24/30)患儿的致病性CNVs包含相关的心脏致病基因。  结论:  1.染色体微阵列分析技术在婴幼儿患先天性心脏病且染色体核型结果正常的人群中,使总体致病性CNVs的检出率达到28.3%,VOUS的检出率为2.8%。  2.在单一类型先天性心脏病和复合类型先天性心脏病婴幼儿组中,使用CMA对致病性CNVs的检出率无明显差异。  3.CMA在先天性心脏病不同类型婴幼儿分组中,致病性CNVs的检出率由高至低分别为:左室流出道梗阻+右室流出道梗阻,先天性肥厚型心肌病,右室流出道梗阻,左室流出道梗阻,动脉导管未闭,隔膜缺损,圆锥动脉干缺损。左室流出道梗阻和/或右室流出道梗阻最可能与染色体微缺失/微重复有相关性。  4.CHD合并精神发育迟滞/生长发育迟缓婴幼儿组中,致病性CNVs的检出率最高,达63.2%。  5.在患CHD和/或其他异常的婴幼儿中,使用CMA检测,除常见22q11微缺失/微重复综合征及Williams-Beuren综合征外,还发现多种不同类型综合征Angleman综合征,Wolf-Hirschhorn综合征,Schinzel-Giedion综合征,15q24微缺失综合征,1p36微缺失综合征,Cornelia de Lange综合征,马凡综合症,Opitz G/BBB综合征。  6.染色体15q11.2区段缺失和1q43-q44区段缺失可能与CHD的发病有相关性。DVL1,SKI,STIM1,CTNNA3和PLN基因可能作为CHD致病的候选基因。  7.染色体微阵列分析技术有重要的遗传病因学研究价值,推荐作为CHD且染色体核型结果正常婴幼儿的常规检测方法,特别是CHD合并精神发育迟滞/生长发育迟缓的婴幼儿。
其他文献
随着中国社会经济步入新时代,中国证券业也面临着新的机遇和挑战.证券公司在证券市场上担任着投资者、信息提供者、资本中介等多种角色,处于行业的核心枢纽,是证券业风险的汇
随着国内市场化竞争不断加剧,公司也在激烈的竞争市场中,通过改革内部的经营机制,来推动公司的持续稳定发展.公司通过对单位内部的各个部门和人员开展绩效评价,来提高单位业
我国市场经济体制建设逐步完善,促使市场竞争越来越激烈.企业要想在竞争激烈的市场经济中获取进一步发展,就要重视资金管理工作的重要性,并基于资金池管理模式的要求提高全面
本研究选用Philips256层螺旋CT进行冠状动脉CTA检查,检出左前降支心肌桥,研究左前降支心肌桥-壁冠状动脉的影像特征和动脉粥样硬化斑块的相关性。  第一部分 应用多层螺旋CT