CMT2L型致病基因的克隆与CMT的SIMPLE、RAB7、LMNA和MTMR2基因突变分析

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第一部分CMT2L型致病基因的克隆腓骨肌萎缩症(CMT)是一种具有遗传异质性的周围神经病。我们应用全基因组扫描、连锁分析和单体型分析将一个常染色体显性遗传的腓骨肌萎缩症2型(CMT2)大家系致病基因定位于染色体12q24,个体重组事件分析将致病基因定位于微卫星标记D12S1720和D12S1611之间约6.8cM的区域内,这是一型新的CMT致病基因位点,我们称之为CMT2L型(OMIM号:608673)。为了克隆CMT2L型的致病疾因,我们采用定位-候选克隆法在前期工作中已经排除了11个候选基因为致病基因,本研究中我们又选择了15个候选基因进行突变分析,分别为SIRT4、CABP1、KSR2、ABCB9、RNF34、HM74、MONDOA、MSI1、PLA2G1B、SFRS9、RFC5、EIF281、Hsp22、GTF2H和P2RX7。通过突变分析,我们发现Hsp22基因423G→T变异与疾病表型共分离,并且在100个正常对照中未检测到该变异,表明它是致病突变,自此我们成功克隆了CMT2L型的致病基因。我们还发现了以下单核苷酸多态(SNP):KSR2基因2498A→G;RFC5基因IVS8-6A→G、IVS9+52A→C、IVS10-22A→G;P2RX7基因227T→C、463T→C、IVS6-5C→G、1267G→A。其中RFC5基因IVS9+52A→C和P2RX7基因1267G→A为新发现的SNP;随后我们应用聚合酶链反应(PCR)结合DNA序列分析方法,对历年收集的另外116个CMT家系的先证者进行了Hsp22基因的突变分析,未发现致病突变,仅发现582C→T多态,表明该基因在我国CMT患者中的突变率低(0.9%)。第二部分腓骨肌萎缩症SIMPLE、RAB7、LMNA和MTMR2基因突变分析为探讨脂多糖诱导的肿瘤坏死因子α基因(LITAF/SIMPLE)、RAS相关GTP结合蛋白7基因(RAB7)、核纤层蛋白A/C基因(LMNA)和肌管蛋白相关蛋白2基因(MTMR2)在我国CMT患者中的突变特点,应用PCR结合DNA序列分析方法对6个常染色体显性遗传CMT家系先证者和27个散发患者进行SIMPLE基因突变分析;用PCR-SSCP并结合DNA序列分析方法对6个常染色体显性遗传CMT家系先证者和27个散发患者进行RAB7基因突变分析、对14个常染色体隐性遗传CMT家系先证者和27个散发患者进行了LMNA和MTMR2基因突变分析,以上患者均已排除PMP22基因大片段重复突变和PMP22、MPZ、EGR2、Cx32、NEFL、GDAP1、Hsp22、Hsp27基因点突变,我们发现了以下SNP:SIMPLE基因269G→A、274A→G和LMNA基因1243G→A、1910C→T,在RAB7基因和MTMR2基因未发现序列变异,其中SIMPLE基因269G→A,LMNA基因1243G→A和1910C→T为新发现的SNP。本研究表明SIMPLE基因、RAB7基因、LMNA基因和MTMR2基因突变在我国CMT患者中罕见。
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