本论文对从花生、辣椒、月季、小檗、黄瓜、豇豆等几株植物的内生菌进行了初步研究，具体包括内生菌的分离纯化、菌株鉴定及发酵产物活性评价、活性菌株次生代谢物的分离及结构鉴定等，取得的主要研究成果如下：1.采用组织切块法和组织匀浆法，从花生、辣椒、月季、小檗、黄瓜、豇豆等植物的叶片、茎秆及根部共筛选到内生菌124株，其中内生真菌63株，内生放线菌61株。2.采用管碟法和抑制菌丝生长速率法评价了124株内生菌发酵液的抑菌活性，从中筛选到41株抗细菌菌株和18株抗真菌活性菌株。3.对豇豆内生真菌F52进行了系统研究，通过分子学鉴定将其鉴定为Aspergillusflavus F52，采用乙酸乙酯萃取、乙醇重结晶等方法，从其发酵液中分离得到一个高产量的化合物（XN01），经核磁共振波谱、高分辨质谱及红外光谱等方法鉴定为曲酸。初步发酵条件优化结果表明，在原有配方的基础上，将葡萄糖添加为20g/L、蔗糖40g/L，发酵12天，曲酸发酵含量可达24.44g/L。4.采用大孔吸附树脂吸附和硅胶柱层析等技术，从黄瓜根内生真菌F60发酵液中分离鉴定出一个抗真菌活性化合物，经高分辨质谱、核磁共振波谱和红外光谱等方法鉴定为间二羟基苯甲酸大环内酯类抗生素——根赤壳菌素（Radicicol）。抑菌活性测定结果表明，根赤壳菌素对番茄灰霉病菌Botrytis cinerea的菌丝生长具有强烈的抑制作用。