基于热力学约束的克雷伯氏杆菌产1,3-丙二醇代谢通量优化分析

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基于热力学约束的代谢通量分析能获得热力学可行的通量分布,提高预测的准确度,成为目前基因组规模代谢网络的研究热点。本文以1,3-丙二醇(1,3-propanediol,简称1,3-PD)为目标产物,对克雷伯氏杆菌基因组尺度代谢网络模型iYL1228添加了热力学约束,并对其进行了代谢通量分析,着重考察了还原当量对最优路径冗余性的影响,并对代谢网络进行还原型辅因子特异性优化分析。首先,针对甘油生物转化为1,3-PD代谢系统,采用代谢网络分析软件COBRA对基因组尺度克雷伯氏杆菌代谢网络进行了热力学约束的通
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