本研究利用分子标记和形态标记对50份旱地小麦种质的遗传差异及其遗传多样性进行了研究，旨在为抗旱丰产小麦新品种选育和生产实践提供材料和理论支持。主要结果如下:　　 1.利用分布在小麦21对染色体上的27对SSR引物对50份旱地小麦种质材料进行了分析，共检测到127个等位位点，平均每个位点检测到4.7个等位变异，变化范围为2-8个。与相关的研究比较发现，本试验所选材料的位点变异范围较小、平均等位变异个数较少。　　 2.根据27个标记的结果计算了50份材料的遗传相似系数，其变化在0.46-0.89之间，平均为0.68，在材料间的遗传相似系数中，以西农811与西农928间的最大，为0.89，最小的是山农16与西农961，为0.68。聚类分析把50份材科聚类为8个类群，其结果较好地反映出材料间的亲缘关系，进一步证实了SSR标记用于遗传差异研究的可靠性。　　 3.本试验所选50份旱地小麦种质在雨养和灌水两个处理下株高、单株穗数、穗长、每穗的总小穗数、不孕小穗数、穗粒数及千粒重7个农艺性状的表现上具有较为广泛的变异区间。变异系数最大的是不孕小穗数，为33.03％和33.48％,其次是成穗数22.26％和22.96％，变异系数最小的是小穗数，为7.03％和6.42％。　　 4.根据水旱条件下共14个农艺性状的表现，计算了50个材料间的欧氏距离，其变异区间为0.94-11.02，平均值为3.51。在这些材料中，欧氏距离最小的是西农961与运旱618，为0.94，欧氏距离最大的是碧玉麦与石家庄407，为11.02。利用农艺性状的欧式距离对材料进行聚类分析，把所有材料分为8个类群。比较了农艺性状标记和SSR标记的聚类结果，表现为两者吻合率非常低。　　 5.对50份旱地小麦材料7个农艺性状的旱水比值分析表明，不同性状对水分的敏感程度不同，种质间的性状旱水比值差异较大，说明品种间抗旱性存在较大的遗传差异。