ddPCR检测非小细胞肺癌血浆cfDNA中EGFR突变及与TKIs相关性分析

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目的:本实验旨在验证ddPCR法检测非小细胞肺癌血浆cfDNA中EGFR突变与组织采用第二代测序手段(NextgenerationsequencingNGS)结果进行一致性对比,以及分析EGFR基因突变与临床病理关系,EGFR基因突变丰度和临床特征之间联系及EGFR基因突变与临床应用TKIs疗效的相关性分析。方法:收集2016年8月-2018年12月南华大学附属南华医院及南华附一医院的非小细胞肺癌患者标本,按纳入标准及排除标准纳入实验组,征得患者同意并签署知情同意书后,分别获取其血液及组织切片行基因测序检查。通过ddPCR法检测EGFR基因常见突变位点,即外显子第18、19、21的突变。结果:(1)在190例非小细胞肺癌患者的肿瘤组织中,检测到72例EGFR基因突变,EGFR突变丰度与性别、吸烟史差异无统计学意义;EGFR突变丰度与病理分型存在统计学上的显著差异。与非腺癌对比,腺癌患者EGFR基因突变丰度明显更高。(2)在190例患者中,组织EGFR突变阳性患者72例,其中Exon21 L858R(+)44例(3例合并T790耐药),Exon19del(+)28例(1例合并T790M突变),血浆cfDNA中EGFR基因突变阳性患者56例,其中包含Exon21 L858R(+)32例,Exon19del(+)24例,血浆EGFR基因突变的灵敏度为69.4%,特异度为94.9%。组织EGFR突变阳性患者应用EGFR-TKIs中位PFS为328天(95%CI,288.610-367.390),组织突变阴性患者中位PFS为146天(95%CI,107.672-184.328),两者相比具有统计学差异(P<0.05),提示临床上应用EGFR-TKIs治疗有效。结论:在非小细胞肺腺癌中,EGFR基因突变丰度与患者年龄、性别、肿瘤分期和有无吸烟史无明显相关性。通过ddPCR方法检测血浆cfDNA突变灵敏度和特异度均较高,可以为靶向药物的使用提供可靠的数据。
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