上海重症急性呼吸道感染儿童中人腺病毒分型鉴定与生物学特征分析

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chaowei7838
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目的:  了解上海地区重症急性呼吸道感染(SARI)儿童中人腺病毒(HAdV)的感染状况与生物学特性,对HAdV主要流行株进行病毒分离鉴定与基因组测序,分析其分子生物学及细胞生长特性。  方法:  采集2014年2月到2015年8月上海重症急性呼吸道感染(SARI)患儿鼻咽抽吸物(NPAs)样本648份,进行HAdV分型检测及常见15种呼吸道病毒检测。对HAdV主要流行株进行病毒分离及鉴定,设计HAdV-B型全基因组测序通用引物,对分离获得的6株HAdV进行全基因组序列扩增及序列分析。进一步对6株HAdV-B分离株在HeLa、HCT-18、2BS、Hep-2细胞上进行生长曲线测定。  结果:  第一部分 HAdV检测分型及感染特征分析  上海地区(2014.2-2015.8)SARI 儿童648份鼻咽抽吸物样本中,HAdV阳性样本共检出104例,阳性率为16.05%(104/648)。在2014年春夏季HAdV阳性检出率较高(20.5%-26.7%),2014年秋季到2015年夏季HAdV感染率基本持平(10%-11%)。104份HAdV阳性样本中,单独感染47例(47/104,45.19%)。HAdV与其他呼吸道常见病毒存在较高的合并感染率(54.81%),且与人鼻病毒(HRV)合并感染最高(24/104,23.08%)。  上海地区可检出多种HAdV流行亚型,主要包括HAdV-B7 ( 54.81%, 57/104)、HAdV-B3(29.80%,31/104)、HAdV-C5(3.85%,4/104)、HAdV-C6 (2.88%,3/104)、HAdV-C2(2.88%,3/104)、HAdV-C1(0.96%,1/104)、及HAdV-D53(仅有1例)。  HAdV-B7为本研究优势亚型,相比HAdV-B3引起的临床症状更为严重,常伴有呼吸困难、喘息等症状(P<0.05),且HAdV-B7引起重症肺炎的几率是HAdV-B3的2.40倍(40%vs 16.67%,P=0.0272)。  第二部分 HAdV分离及细胞生物学特性鉴定  选取人胚肺二倍体细胞(2BS细胞)建立HAdV分离培养体系,对HAdV检测阳性样本进行病毒分离。本研究共成功获得6株HAdV-B型毒株,包括3株HAdV-B3(SH210、SH636、SH3020)与3株HAdV-B7(SH181、SH432、SH3127)。进一步鉴定6株HAdV分离株在Hela、HCT-18、2BS、Hep-2细胞上增殖特性,发现不同HAdV-B型毒株在不同细胞上增殖存在差异,确定2BS、Hep-2细胞为HAdV培养的优势细胞系。  第三部分 人腺病毒分离株全基因组序列分析  对6株HAdV-B型分离株进行全基因序列扩增及其进化分析。全基因组分析结果与分型检测结果一致,3株属于HAdV-B3,3株属于HAdV-B7。与已发表的HAdV-B3及HAdV-B7参考株序列同型别间基因组同源性较高(大于99%),仅SH181毒株(HAdV-B7)在DNA 聚合酶/末端蛋白(pTP)处缺失27bp。SH3127毒株(HAdV-B7)在DNA 聚合酶/末端蛋白(pTP)有24bp序列缺失。  结论:  人腺病毒(HAdV)是上海地区SARI儿童感染的重要病原,阳性检出率为16.05%(104/648),可检出多种HAdV流行亚型,主要流行HADV-B型(以B3与B7为主);本研究建立对陈旧呼吸道样本的HAdV分离体系,共成功获得6株HAdV-B型毒株,发现不同HAdV-B型毒株在不同细胞上增殖存在差异。HAdV-B分离毒株全基因组序列分析表明: HAdV-B同型别间基因组同源性较高(大于99%),但发现2个HAdV-B7毒株在DNA 聚合酶/末端蛋白(pTP)处存在基因缺失。本研究为HAdV研究及相应疾病的防控提供了重要科学依据,并可为疫苗以及抗病毒药物研发提供应用工具。
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