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目的: 了解上海地区重症急性呼吸道感染(SARI)儿童中人腺病毒(HAdV)的感染状况与生物学特性,对HAdV主要流行株进行病毒分离鉴定与基因组测序,分析其分子生物学及细胞生长特性。 方法: 采集2014年2月到2015年8月上海重症急性呼吸道感染(SARI)患儿鼻咽抽吸物(NPAs)样本648份,进行HAdV分型检测及常见15种呼吸道病毒检测。对HAdV主要流行株进行病毒分离及鉴定,设计HAdV-B型全基因组测序通用引物,对分离获得的6株HAdV进行全基因组序列扩增及序列分析。进一步对6株HAdV-B分离株在HeLa、HCT-18、2BS、Hep-2细胞上进行生长曲线测定。 结果: 第一部分 HAdV检测分型及感染特征分析 上海地区(2014.2-2015.8)SARI 儿童648份鼻咽抽吸物样本中,HAdV阳性样本共检出104例,阳性率为16.05%(104/648)。在2014年春夏季HAdV阳性检出率较高(20.5%-26.7%),2014年秋季到2015年夏季HAdV感染率基本持平(10%-11%)。104份HAdV阳性样本中,单独感染47例(47/104,45.19%)。HAdV与其他呼吸道常见病毒存在较高的合并感染率(54.81%),且与人鼻病毒(HRV)合并感染最高(24/104,23.08%)。 上海地区可检出多种HAdV流行亚型,主要包括HAdV-B7 ( 54.81%, 57/104)、HAdV-B3(29.80%,31/104)、HAdV-C5(3.85%,4/104)、HAdV-C6 (2.88%,3/104)、HAdV-C2(2.88%,3/104)、HAdV-C1(0.96%,1/104)、及HAdV-D53(仅有1例)。 HAdV-B7为本研究优势亚型,相比HAdV-B3引起的临床症状更为严重,常伴有呼吸困难、喘息等症状(P<0.05),且HAdV-B7引起重症肺炎的几率是HAdV-B3的2.40倍(40%vs 16.67%,P=0.0272)。 第二部分 HAdV分离及细胞生物学特性鉴定 选取人胚肺二倍体细胞(2BS细胞)建立HAdV分离培养体系,对HAdV检测阳性样本进行病毒分离。本研究共成功获得6株HAdV-B型毒株,包括3株HAdV-B3(SH210、SH636、SH3020)与3株HAdV-B7(SH181、SH432、SH3127)。进一步鉴定6株HAdV分离株在Hela、HCT-18、2BS、Hep-2细胞上增殖特性,发现不同HAdV-B型毒株在不同细胞上增殖存在差异,确定2BS、Hep-2细胞为HAdV培养的优势细胞系。 第三部分 人腺病毒分离株全基因组序列分析 对6株HAdV-B型分离株进行全基因序列扩增及其进化分析。全基因组分析结果与分型检测结果一致,3株属于HAdV-B3,3株属于HAdV-B7。与已发表的HAdV-B3及HAdV-B7参考株序列同型别间基因组同源性较高(大于99%),仅SH181毒株(HAdV-B7)在DNA 聚合酶/末端蛋白(pTP)处缺失27bp。SH3127毒株(HAdV-B7)在DNA 聚合酶/末端蛋白(pTP)有24bp序列缺失。 结论: 人腺病毒(HAdV)是上海地区SARI儿童感染的重要病原,阳性检出率为16.05%(104/648),可检出多种HAdV流行亚型,主要流行HADV-B型(以B3与B7为主);本研究建立对陈旧呼吸道样本的HAdV分离体系,共成功获得6株HAdV-B型毒株,发现不同HAdV-B型毒株在不同细胞上增殖存在差异。HAdV-B分离毒株全基因组序列分析表明: HAdV-B同型别间基因组同源性较高(大于99%),但发现2个HAdV-B7毒株在DNA 聚合酶/末端蛋白(pTP)处存在基因缺失。本研究为HAdV研究及相应疾病的防控提供了重要科学依据,并可为疫苗以及抗病毒药物研发提供应用工具。