CDR3结构域对抗AFB1单域重链抗体性质及亲和力的影响

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:terzaghi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
黄曲霉毒素B1(Aflatoxin B1,AFB1)是一类污染农产品、危害人类健康的常见污染物。在免疫分析中,单域重链抗体(VHH)的独特性质引起了人们的注意。与大分子抗原相比,在小分子半抗原(如AFB1)中,比一般抗体互补决定区3(CDR3)长度更长的VHH CDR3的作用仍不清楚。因此,基于VHH CDR3的研究可以探究其与小分子半抗原的亲和力及相互作用,有助于在基因水平上重塑VHH,从而扩展其在食品安全监控领域的应用。在本研究中,从天然的VHH抗体库中筛选出抗AFB1 VHH,并以此VHH为模板,在其CDR3结构域中引入三核苷酸随机化,从而构建半合成的抗AFB1噬菌体展示文库。借助已报道的来自免疫羊驼的抗AFB1 VHH Nb28的帮助构建VHH嵌合体,进一步探索了 CDR3在影响抗AFB1 VHH亲和力中的作用。本研究的主要结果和创新点如下:1.天然抗体库的构建与抗AFB1 VHH的筛选以未经免疫的羊驼血清构建天然的VHH文库:从羊驼外周血淋巴细胞中提取总RNA,反转录为cDNA后利用PCR扩增VHH基因。将VHH基因与噬菌粒载体pComb3X连接并电转化至大肠杆菌ER2738感受态细胞中构建VHH噬菌体展示文库,文库容量为1.5x107cfu/mL。经过四轮竞争-洗脱-生物淘洗后,筛选出抗AFB1 VHH克隆(VHH-2)。在原核表达系统中表达VHH-2,经Ni-NTA亲和柱纯化,SDS-PAGE验证VHH-2的产量约为15.5mg/L,具有良好的溶解性和较高的得率。用phage-ELISA、VHH-ELISA和生物素多肽-ELISA(一种模拟AFB1的多肽)三种方式检测VHH-2对AFB1的结合能力,结果显示AFB1与VHH-2有竞争性结合。经表面等离子体共振(SPR)测定VHH-2与AFB 1的平衡解离常数KD约为6.33x10-5m。第一章的结果表明来自原始VHH文库的VHH-2与-AFB 1具有结合能力。2在CDR3区域引入随机化构建半合成VHH文库采用半胱氨酸保守和无终止密码子的NNK6(C)NNK7模式合成寡核苷酸,在VHH-2框架内的CDR3结构域中引入随机化构建半合成VHH文库,文库容量为1.55x108 cfu/mL,正确插入率>95%。根据与AFB1竞争结合能力的不同,筛选出3个不同的CDR3的随机VHHs克隆(7M、20M和27M),经SDS-PAGE和Western blot分析发现3个VHH的表达量远低于VHH-2。将3个VHH与-AFB1进行分子模拟和对接发现在VHH-2中,CDR3上的Thr-106、Tyr-115、Trp-109和Thr-114分别与-AFB1形成两个氢键和两个疏水相互作用;在突变体20M和27M上,CDR3区的Gly-1 13与-AFB1形成疏水作用、Ser 103与-AFB1之间形成氢键;在7M中显示CDR3的结合丧失可能是影响随机化VHH可溶性表达的主要原因。从所有随机VHHs的结果来看,CDR3区域的氢键和疏水相互作用明显促进了 VHHs与AFB1的结合能力。3.构建VHH嵌合体探究CDR3的作用本章利用VHH-2的框架区(FRs)和已报道的高亲和力抗AFB1-VHH-Nb28构建VHH嵌合体,研究CDR3在抗AFB1 VHHs中的作用。两个VHH嵌合体(C3-Nb28和C3-VHH2)是通过将VHH-2的CDR3区与Nb28互换合成的。经SDS-PAGE和Western blot检测,结果显示使用pComb3X载体表达时,所有的嵌合体都不表达,而在pET-22b中,C3-Nb28从包涵体中提取,C3-VHH2为可溶性蛋白。采用VHH-ELISA法检测两种VHH嵌合体对AFB 1的竞争性结合抑制作用,CDR3区的Cys残基和二硫键缺失可能是CDR3区导致表达缺失的原因。结合分子对接分析,两种VHH嵌合体CDR3区均无结合囊。在C3-VHH2中,结合囊转移至CDR1和CDR2区域,而在C3-Nb28中,FR2和FR3参与了嵌合体与AFB1的疏水相互作用。因此,可以认为CDR3不仅在VHH与AFB1的结合囊形成中起关键作用,而且在可溶性表达和产量方面与VHH的表达框架区具有协同作用。
其他文献
通过对汾阳市耕地占补平衡现状问题进行分析,发现汾阳市耕地后备资源紧缺,补充耕地指标满足不了建设用地需求,补充耕地项目类型单一,大部分通过异地补充进行占补平衡等问题,对策建议如下:引进社会资本投入,大力推进综合整治项目;盘活存量、遏制增量;拓宽补充耕地渠道,积极恢复耕地;省域统筹协调,规范交易平台;备案系统需继续更新。
期刊
高压直流输电非常适合长距离、大容量电能输送,接地极是高压直流输电系统的重要组成部分。深井型高压直流接地极因为子电极数量少,占地面积小,有效缓解了接地电极选址困难的问题,应用前景广阔。但是由于其“端部效应”,电极端部的电流密度可能非常高,温升已成为限制深井接地技术发展的重要因素,关系到其能否正常稳定运行。针对深井接地极的结构和环境特点,本文围绕大地电阻率勘测、建模和饱和水地下介质温度特性等关键问题,
学位
报纸
审计机关作为监督管理部门,在国家省级层面关于预算绩效管理政策法律更新的背景下,需开展科学合理的预算绩效全过程审计工作。本文首先分析了预算绩效管理全过程审计的背景及意义;接着提出预算绩效管理全过程审计需实现的目标;其次基于目标确定预算绩效管理全过程审计的内容和重点,提出各级审计机关依据部门职能要求,应依法对预算绩效管理的实行效果开展审计监督;最后针对工作重点明确预算绩效管理全过程审计的完善路径。本文
期刊
从投资决策、设计、招投标以及施工4个阶段分析了公路工程造价的影响因素,并据此提出了工程造价控制策略。以某高速公路项目作为研究背景,深入分析了该案例项目的具体特点和造价特点,并提出了案例项目造价控制的具体措施。
期刊
随着犯罪圈的扩张,司法资源的有限性日益凸显。在结构视野的价值层面,相对不起诉繁简分流的诉讼经济考量与“非刑罚化”的修复理念均得到了重视;在制度层面,“少捕慎诉慎押”刑事政策的确立与认罪认罚从宽制度的推行,业已证明不起诉的发展迈入新阶段,其扩张适用在未来不可避免。然而就现状而言,相对不起诉适用虽已得到改善,但制度设计与实践运用仍有所欠缺。为保障制度的可持续发展,可以从“检察一体”、司法实践、数字法治
期刊
农村公路是系统性的工作,在农村公路项目开展的过程中做好工程造价控制非常关键。但就目前而言由于各种客观因素的影响,使得农村公路工程造价的控制水平难以达到实际的要求。因此为了不断的促进企业的发展,做好农村工程的工作。结合实际在探讨农村公路主要特点的基础上,对农村公路工程造价管理存在的难点问题进行了分析,并且对提高农村公路工程造价的控制方案进行研究,希望认出之后,可以给相关工作人员提供借鉴。
期刊
<正>有这样一位放弃城市里舒适的工作环境,扎根基层,在平凡的工作岗位上,默默无闻地辛勤劳动,尽心竭力推广先进科学的种植技术,为农民增收致富奉献光和热的农业科技工作者。用她自己的话:"只要农民群众满意,老百姓能过上好日子,就是我最大的乐趣"。她就是宁夏银川市金凤区农业技术推广中心高级农艺师王金燕。
期刊
水库调度是实现洪水资源安全高效利用的关键技术手段。在新时期下,流域内协同防洪的水库数量不断增加,洪水资源管理需求越来越复杂,迫切需要系统性地开展复杂水库群联合防洪调度研究,从而弥补传统单库调度理论方法的不足。因此,本论文以汉江流域水库群系统为研究对象,从水库群防洪库容联合设计、水库群防洪库容分配规则、水库群汛期运行水位动态控制3个方面,研究水库群系统汛期运行水位联合设计、运行及风险控制问题。论文的
学位
目的 观察腰椎间盘突出症患者术后神经功能恢复情况,并分析术后神经功能恢复不良的影响因素。方法 采用前瞻性队列研究方法,对南阳市中心医院2018年2月至2021年12月收治的224例腰椎间盘突出症患者进行研究,所有患者均随访6个月,根据患者术后6个月神经功能恢复情况,分成不良组和良好组,同时设计患者一般资料表,将可能的影响因素纳入,分析影响腰椎间盘突出症患者术后神经功能恢复不良的相关因素。结果 术后
期刊