论文部分内容阅读
卵巢癌是严重威胁女性健康的疾病,死亡率居妇科恶性肿瘤之首。多药耐药是卵巢癌患者术后化疗失败主要原因,而DNA甲基化则是卵巢癌多药耐药调控的重要机制。因此,全面了解DNA甲基化对卵巢癌及卵巢癌多药耐药的调控机制对于卵巢癌治疗和预后具有重要意义。通过PUMMED数据库检索,本文共提取了27个与卵巢癌多药耐药调控显著相关的DNA甲基化基因,系统整合分析了这些基因甲基化水平改变对卵巢癌耐药的影响及其分子调控机制。在所有27个基因中,至少一半以上的DNA甲基化基因直接或间接的通过调控细胞凋亡信号通路响应耐药调控,说明该信号通路可能是DNA甲基化基因行使其耐药生物学功能的主要方式。另外,本文还综合分析了这27个卵巢癌耐药相关甲基化基因与临床恶性行为及预后的关系,结果表明上述基因主要与不良预后相关。综上,本文整合性分析了已报道的27个DNA甲基化基因与卵巢癌耐药之间的潜在关系,这对于我们深入了解DNA甲基化对卵巢癌耐药的调控,及卵巢癌治疗和提高卵巢癌的预后具有一定的指导意义。目的：通过综合已有研究和生物信息学分析整体性研究DNA甲基化对卵巢癌多药耐药的调控。方法：通过PUMMED数据库检索提取已报道的与卵巢癌耐药调控相关的DNA甲基化基因。通过DAVID,Coremine Medical及String等工具进行生物学过程富集与注释及基因/蛋白互作等生物信息学分析。结果：共筛选出27个与卵巢癌多药耐药调控显著相关的DNA甲基化基因,并系统整合了这些基因甲基化水平的改变对卵巢癌耐药的调控机制。蛋白互作结果显示这27个甲基化基因中至少有20个存在于蛋白互作网络中,说明它们存在彼此互作,在功能上具有相关性,可能作为一个整体参与卵巢癌耐药调控。其中PTEN与至少一半的其它基因存在直接互作,说明其在上述基因中可能具有核心调控功能。生物学过程富集与注释表明上述DNA甲基化基因大多与细胞凋亡显著相关,可能是这些基因参与卵巢癌多药耐药调控的重要途径。结论：本文从整体性角度初步解释了DNA甲基化基因与卵巢癌耐药之间的潜在关系,这对于我们深入了解甲基化基因对卵巢癌耐药的调控作用,及治疗卵巢癌和提高卵巢癌的预后具有一定的指导意义。目的：结肠腺瘤样息肉病基因APC属于肿瘤抑制基因。其基因的失活在卵巢癌的发生发展中发挥着关键的作用。许多研究讨论了关于APC基因甲基化与卵巢癌的关系,我们进行了meta分析更进一步确认APC基因与卵巢癌之间的关系。方法：我们使用一些搜索软件如PUBMED、EMBASE、Web of science及CNKI数据库搜索相关文献,纳入研究。并使用STATE11.01软件进行RR风险值、异质性及发表性偏倚的相关的统计学分析。结果：9篇文献被纳入该meta分析中,其中包括641个卵巢癌的病人及377个对照组病例。统计学结果表明：总病例组与总对照组OR=6.19,95%CI：4.08—9.41,P<0.05。肿瘤组织与正常组织合并的OR=5.88,95%CI.3.662—9.450,P<0.05。肿瘤组织与良性组织OR=6.99,95%CI：3.124—15.645,P<0.05。结论：此结果表明APC基因的甲基化与卵巢癌之间有密切的关系。目的：本研究使用甲基化芯片检测多组卵巢组织基因组DNA的差异甲基化位点,并且采用基因通过富集分析的方法筛选出与卵巢癌多药耐药相关的差异生物学通路及其所包含的差异甲基化基因。方法：采用450K Infinium Methylation BeadChip芯片,检测54例卵巢上皮癌耐药组织、54例敏感组织、54例卵巢良性肿瘤和54例正常卵巢组织的差异甲基化位点获得卵巢上皮癌耐药组和敏感组Beta score值差异大于1倍的上调或下调的DNA。运用GO分析和Pathway通路富集等生物信息学方法分析差异表达DNA潜在的生物学功能和参与的信号通路。用QRT-PCR验证芯片结果,检测差异甲基化的表达情况,并分析差异甲基化基因表达水平与临床病理因素关系。结果：DNA芯片筛选出于卵巢上皮癌多药耐药相关差异化甲基化位点7263个差异化甲基化位点,其中涵盖2654个基因。耐药组织中甲基化程度较敏感组升高位点有6051个,基因2162个,甲基化程度较敏感组降低位点有1212个,基因452个,其中差异甲基化发生在启动子区的有1058个基因,发生在转录起始5’UTR区的基因有305个。生物信息学分析这些差异甲基化基因主要参与了肿瘤途径、黏附、雌激素信号通路、ECM-受体相互作用、P13K-AKT信号通路、ErbB信号通路、子宫内膜癌、白细胞跨内皮迁移、扩张性心肌病等信号通路。我们选取了差异显著的高甲基化基因PIK3R3和LAMA3做了QRT-PCR对芯片结果做了临床验证,PIK3R3和LAMA3基因表达耐药组较敏感组下调,扩大临床样本验证亦得到了一致的结果,其中PIK3R3和LAMA3基因在卵巢癌耐药组织中分别下调1.56倍、1.87倍,差异有统计学意义(P<0.05)。结论：利用基因芯片筛选出了跟卵巢上皮癌多药耐药相关的差异的甲基化位点及基因,丰富了目前已知的跟耐药相关的靶基因数据。后期需要进一步研究差异甲基化基因参与卵巢上皮癌耐药发生的相关分子机制及其与临床各因素的关系。