论文部分内容阅读
肝癌在全球范围内的致死率与发病率都位居前列,是人类生命健康的巨大威胁。而目前针对肝癌患者的诊治手段有限,肝癌患者的五年生存率极低。因此,揭示肝癌的发生发展中的分子机制显得尤为重要。近年来,随着对RNA修饰的不断研究,m6A在癌症中的重要性日益突显,为癌症发生发展的分子机制提供了新的思路。而m6A在肝癌中的作用还未得到完全阐明。基于以上原因,本文从TCGA和GEO数据库中获得了4个包含肝细胞癌样本高通量测序或芯片数据的数据集。选取m6A关键调节基因METTL3、METTL14、WTAP、FTO、ALKBH5、YTHDF1和YTHDF2,分析它们在肝细胞癌中的表达变化趋势。结果显示,肝癌组织中YTHDF1和YTHDF2的表达量显著高于癌旁组织。生存分析显示,YTHDF1、YTHDF2高表达患者具有更差的总生存时间(p<0.001,p<0.001)和无病生存时间(p=0.0116,p=0.002)。另外,结合患者临床数据,本文发现YTHDF1、YTHDF2的高表达与肝癌进展相关。基因集富集分析提示,YTHDF1与肝癌细胞DNA复制、细胞外基质互作有关;YTHDF2与肝癌细胞周期、细胞外基质互作有关。肝癌样本Ch IP-seq数据显示,组蛋白H3K4me3可能调控了YTHDF1的表达。通过在肝癌细胞系中敲低或过表达YTHDF1/YTHDF2,本文发现YTHDF1与肝癌细胞的增殖无关,而YTHDF2的低表达会显著抑制肝癌细胞的增殖。此外,YTHDF1的低表达会促进肝癌细胞迁移,而YTHDF2的敲低会抑制肝癌细胞迁移。