论文部分内容阅读
1 研究背景与目的病毒性肝炎是一类由病毒引起的以肝脏病变为主要病理表现的感染性疾病。一些小型哺乳动物如鼠和鼩鼱等,可向人类传播多种人畜共患病原体,例如可以导致人类肝炎的鼠戊型肝炎病毒和汉坦病毒。导致肝炎的病毒一般具有肝脏嗜性,但由于肝脏血流丰富,一些不具有肝脏嗜性的病毒可随着血液循环进入肝脏从而被检出。了解鼠和鼩鼱等动物肝脏和血清中病毒的携带情况和基因特征,分析病毒的组织嗜性和跨物种传播的可能性,可以增进我们对人类病毒性肝炎可能传播来源的认识,有利于病毒性肝炎的预防和控制。2 研究内容和方法2.1 样本的采集从中国南方8个城市和地区收集家栖鼠（褐家鼠和黄胸鼠）、野鼠（黄毛鼠和板齿鼠）、鼩鼱（臭鼩鼱）和蝙蝠（小黄蝠、中蹄蝠、犬蝠、东亚家蝠、中菊头蝠和菲菊头蝠）等几种野生小型哺乳动物的肝脏组织样本,以及家栖鼠（褐家鼠和黄胸鼠）、野鼠（黄毛鼠）和鼩鼱（臭鼩鼱）的血清样本。此外,还收集实验室大鼠和小鼠的肝脏组织样本。2.2 鼠、鼩鼱和蝙蝠肝脏的宏病毒组学研究采用宏病毒组学方法,探讨在2015年和2016年从中国南方几个地区捕获的家栖鼠（褐家鼠和黄胸鼠）、鼩鼱（臭鼩鼱）、蝙蝠（小黄蝠、中蹄蝠、犬蝠和东亚家蝠）以及实验室大鼠和小鼠的肝脏病毒群落构成。2.3 褐家鼠血清与肝脏的宏病毒组学研究采用宏病毒组学方法,探讨在2018年从福建省厦门市捕获的褐家鼠的血清和肝脏的病毒群落构成。2.4 鼠、鼩鼱及蝙蝠肝脏和血清中十九种病毒的流行病学调查采用PCR方法对鼠、鼩鼱和蝙蝠等几种野生小型哺乳动物的肝脏和血清样本进行19种病毒的检测,了解这些病毒在动物中的流行情况和基因特征。3 研究结果3.1 样本的基本情况共计收集了 1259份肝脏组织样本和572份血清样本。其中,肝脏组织样本来自677只褐家鼠、71只黄胸鼠、98只黄毛鼠、1只板齿鼠、200只臭鼩鼱、121只小黄蝠、52只中蹄蝠、21只犬蝠、6只东亚家蝠、1只中菊头蝠、1只菲菊头蝠、5只实验室SD大鼠和5只BALB/C小鼠;血清样本来自397只褐家鼠、20只黄胸鼠、28只黄毛鼠、67只臭鼩鼱和60只小黄蝠。3.2 鼠、鼩鼱和蝙蝠肝脏的宏病毒组学研究不同动物肝脏的病毒群落构成不同。在蝙蝠、鼩鼱、实验室大鼠和小鼠肝脏中,逆转录病毒科（Retroviridae）和疱疹病毒科（Herpesviridae）病毒序列的相对丰度之和占哺乳动物病毒序列相对丰度的90%以上;在家栖鼠肝脏中,正粘病毒科（Orthomyxoviridae）病毒序列的相对丰度（＞18%）较其它动物高。3.3 褐家鼠血清与肝脏的宏病毒组学研究疱疹病毒科（Herpesviridae）和逆转录病毒科（Retroviridae）是褐家鼠肝脏样本中相对丰度最高的两个病毒科;而指环病毒科（Anelloviridae）则是血清中相对丰度最高的病毒科（相对丰度＞90%）。肝脏中正粘病毒科（Orthomyxoviridae）病毒序列的相对丰度较血清高。3.4 鼠、鼩鼱及蝙蝠肝脏和血清中十九种病毒的流行病学调查对来自于鼠、鼩鼱和蝙蝠等几种野生小型哺乳动物的1225份肝脏组织样本和342份血清样本进行了 19种病毒的检测。在鼠、鼩鼱和蝙蝠的肝脏样本中,嗜肝DNA病毒的检出率分别为0.36%、1.50%和0.99%;甲型流感病毒的检出率分别为2.19%、38.50%和2.97%;疱疹病毒的检出率分别为16.65%、2.00%和20.79%。寨卡病毒可在鼠（0.49%）和鼩鼱（1.00%）的肝脏样本中检出。腺病毒和甲型肝炎病毒序列分别在鼠（0.12%）和蝙蝠（0.99%）的肝脏样本中检出。这些病毒在血清样本中均无检出。持续性G病毒和细环病毒在鼠和鼩鼱的肝脏和血清样本中均有检出,两种病毒在鼠血清样本中的检出率最高,分别为15.00%和60.00%。戊型肝炎病毒不仅可在鼠（15.07%）和鼩鼱（0.50%）的肝脏样本中检出,也可在鼠的血清样本中检出（2.50%）。博卡病毒和汉坦病毒序列仅在鼠肝脏和血清样本中检出,博卡病毒的检出率分别为2.19%和1.88%;汉坦病毒的检出率分别为6.88%和5.94%。蝙蝠、鼠和鼩鼱中检出的嗜肝DNA病毒序列与人乙型肝炎病毒B型序列高度相似;鼠和鼩鼱中检出的寨卡病毒序列与人和蚊子寨卡病毒序列高度相似,但是由于本研究未获得这些病毒的全基因组序列,需要进一步研究病毒的基因特征和人畜共患的可能性。鼠戊型肝炎病毒和汉坦病毒为人畜共患病毒,这两种病毒在鼠中的检出率较其它动物高,获得的病毒序列分别与以往报道的鼠戊型肝炎病毒和汉坦病毒序列高度相似。本研究检出的甲型肝炎病毒、腺病毒、疱疹病毒、博卡病毒、持续性G病毒和细环病毒序列与相关的人类病毒序列的相似程度较低,提示这些动物病毒由鼠、鼩鼱和蝙蝠传播给人类的可能性较小。4 结论（1）家栖鼠、鼩鼱、蝙蝠和实验室大鼠及小鼠肝脏的病毒群落构成存在差异。（2）褐家鼠血清及肝脏的病毒群落构成不同。（3）与蝙蝠和鼩鼱相比,鼠携带的病毒种类较多,提示需要重视鼠在肝脏病毒性感染性疾病传播中的作用。