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目的:本文运用一种系统药理学策略,采用概率集成方法,以著名的中药复方---瓜蒌薤白汤(GXD)治疗冠心病为例,来剖析中药复方治疗冠心病的协同活性成分,为冠心病的临床治疗提供新的视角。方法:(1)根据药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄(ADME)等药代动力学特征,筛选瓜蒌薤白汤种的潜在活性成分。(2)通过三种相似性集成方法、加权系综相似度法和系统药物打靶工具的靶标预测方法,得到活性化合物的候选靶标。运用DAVID数据库获取靶标的生物学过程。通过基因富集分析,构建活性化合物的生物学过程网络。结合TCMSP数据库,获得靶标对应的疾病信息,从而构建靶标-疾病网络。(3)结合前两部分的得到活性化合物和潜在靶标信息,构建靶标-活性化合物网络。通过CTD数据库获取冠心病靶蛋白,并结合化合物靶标构建疾病蛋白-蛋白相互作用网络。运用概率集成方法预测瓜蒌薤白汤方剂中潜在的药物组合对。(4)将瓜蒌薤白汤中得到的潜在靶点映射到DAVID数据库中,获取通路的富集分析结果。结合靶标与对应通路的富集分析,构建了靶点-通路网络。在通路水平上,为了研究瓜蒌薤白汤的作用机制,构建了一个整合的冠心病通路。结果:(1)通过药物的ADME评价,我们筛选出16个具潜在生物活性的成分。(2)通过靶标预测方法,获得到150个潜在靶标。根据瓜蒌薤白汤靶点参与的基因本体生物学过程的关联分析可知,许多靶点参与了激素调节、氧化和炎症相关的生物学过程。进一步分析发现,靶标主要参与增殖和炎症响应、代谢调节和氧化应激、类固醇和激素调节。通过靶标-疾病分析发现,多功能的靶点涉及参与冠心病发病的不同阶段。(3)通过靶标-化合物网络的拓扑学分析,结果发现筛选得到的生物活性成分中,每个成分至少调控了18个靶标。表明化合物之间存在潜在的协同效应。通过疾病蛋白-蛋白相互作用网络,将网络模块化,主要得到5个模块,都与冠心病密切相关。本文运用概率系综法)预测瓜蒌薤白汤中存在的可能药物组合对。(4)本文利用靶标-通路网络和融合通路分析来剖析协同机制,并发现药物组合作用于多通路,包括血管平滑肌收缩,胰岛素抵抗,钙信号通路。结论:综上所述,整合了系统药理学方法为瓜蒌薤白汤治疗冠心病的分子机制,提供了较为深入的分析,并提出了一种新的组合治疗的方法。