汉族人群精神分裂症全基因组关联分析研究

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背景精神分裂症(Schizophrenia, SCZ)是精神障碍中非常严重的一种疾病,据流行病学调查研究显示全球发病率为1%,精神分裂症的发病机制尚没有明确定论,目前存在多种假说推测其发病原因。普遍认为它是由遗传和外在环境因素共同引发的,是一种多基因遗传的复杂性疾病,不完全符合简单的孟德尔遗传定律,其遗传效应是由大量微效基因共同作用的结果,遗传度较高可以达到80%。目前国内外很多研究通过遗传学探讨精神分裂症的易感基因,以期明确疾病的发病原因和发病机制。全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)目前生物遗传学广泛应用在多基因遗传疾病的一项重要手段,是在人类全基因组范围内不同于以往以微卫星多态性作为标记而是以单核苷酸多态性(Single Nucleotide Ploymorphism,SNP)作为标记进行筛选,人类全基因组目前可检测百万SNP位点。通过病例组和对照组进行比较分析,探讨精神分裂症与基因之间的关联,寻找与疾病相关的易感基因。目的采用病例对照DNA混合池方法进行基因分型,在全基因范围内筛查与精神分裂症相关联的SNPs位点。方法选择中国汉族精神分裂症患者300例作为病例组,选择中国汉族高原地区青藏铁路建筑工人300例作为对照组。将病例组和对照组的DNA制成高效DNA混合池,采用Affymetrix公司制作的高通量的基因芯片(Genome-wide Human SNP Array6.0)对300例汉族精神分裂症患者和300例青藏铁路身体健康的建筑工人的基因混合池进行全基因组基因扫描和基因分型,我们将对精神分裂症患者和健康青藏铁路工人的DNA的17024个单核苷酸多态性进行等位基因频率的比较。统计分析采用Z值和t做检验,全基因组界值为P<9.2×10-8,相当于Z值>5.3。结果经过病例对照方法,进行全基因组关联分析研究,初步筛选出4个与精神疾病相关联的SNP位点,分别是分别是:rs1710051(NRG3),rs1209328(ETV3), rs1041250(RAB7L1), rs1041250(NUCKS1)。这四个基因位点中与精神分裂症关联度最高的是rs1710051(NRG3),其Z value为8.43。结论1.筛选出4个与精神疾病相关联的基因位点;2.神经调节蛋白-3(NRG3)与精神分裂症具有高度的关联性;3.NRG3可能是精神分裂症的易感基因。
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