食品是人类生存的最基本条件，食品安全是人类生命和健康的重要保证。现代计算机视觉自动检测技术的产生和发展为食品主要污染源之一—微生物的检测技术提供了新的研究方向。本文在已经建立的计算机食品微生物快速检测系统基础上，针对该系统的自动调焦问题做了深入研究，主要研究内容包括以下几个方面：一，本文以彩色图像作为原始图像，基于彩色图像RGB空间提出两种新的关于彩色图像的分割方法，分别为彩色图像平面分割方法及彩色图像高斯分割方法。两种分割方法都能够有效的分离图像中的背景和实体。二，本文在研究了现有基于图像处理技术的显微调焦指导函数基础上，针对显微镜调焦过程特点，提出了三种新的调焦指导函数：基于彩色图像平面分割最大类间方差指导函数、基于彩色图像高斯分割指导函数和基于图像纹理特征互相关程度的调焦指导函数。结合实际工作，对现有和文中提出的调焦指导函数进行了相关实际操作测试和比较，测试结果表明新的调焦指导函数普遍能够较准确的指示最佳对焦点位置，且具有抗干扰能力强、物距响应范围大、极值点明显等特点，与现有调焦指导方法相比，在各性能表现上有显著提高。三，针对光学显微镜调焦指导函数特点，提出了基于同时扰动随机逼近算法和基于抛物线二次曲线拟合的最佳对焦点搜索方法。结合实际应用进行了相关性能检验，证明两种搜索方法可以从当前位置出发，经过迭代计算能够快速准确的找到最佳对焦点位置，实现快速调焦。