基因突变与纯红再障发生的相关性研究

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单纯红细胞再生障碍性贫血(pure red cell aplasia,PRCA),简称纯红再障,是一种罕见的血液系统疾病。分为先天性和后天性两种类型。后天性PRCA又分为特发性和继发性两类。目前认为继发性PRCA的发生与某些疾病如胸腺瘤、细小病毒B19感染以及白血病等相关。但特发性PRCA的发病机制尚不完全清楚,可能与自身免疫异常相关。现阶段特发性PRCA常用的治疗手段是免疫抑制剂类药物如糖皮质激素和环孢素等,这些治疗手段虽然在大多数患者中取得了较好的疗效,然而一旦停药,PRCA常会出现复发。因此,从DNA突变的角度寻找PRCA患者可能的发病机制,将为PRCA药物研发提供新的靶点,进而提高PRCA患者的治疗效果和生活质量。本研究采用二代测序技术,对4例PRCA患者的295个关键基因进行了深度测序,分析后共发现529个突变位点。根据2015版美国医学遗传学与基因组学学会关于基因突变的解释指南和ClinVar数据库,我们将这529个突变分为三组:不确定(uncertain)突变组(25个)、可能良性(likely benign)突变组(20个)及良性(benign)突变组(484个)。并利用两株白血病细胞系(KBM7和K562)Hi-C数据库,对不确定突变组和良性突变组中突变位点的空间聚集性进行了分析,发现与良性突变组相比,不确定突变组中突变位点具有更强的空间聚集性,在KBM7细胞系中P=0.026,在K562细胞系中P=0.044。由于PRCA是罕见病,考虑到在人群中突变频率较高的位点在罕见病中起到关键作用的可能性较低,因此本研究进一步过滤掉在人群中突变频率大于0.001的突变,最终得到分布在15个基因中的17个突变位点。其中FANCF(R61L、I346S)和LRP1B(D3815E、A3882V)基因发生突变概率明显高于其他基因。进一步对突变位点保守性及其对蛋白质结构影响的分析显示,FANCF和LRP1B突变可能影响其蛋白质结构和功能,提示特发性PRCA可能与FANCF和LRP1B的突变有关。以上结果对阐明PRCA的发病原因及探寻更好的治疗手段提供了研究基础。
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