医药行业是关乎国计民生的重要产业。人口老龄化持续扩大、医疗保健制度不断完善使得我国医药市场迅速发展,医药制造行业在中国迎来了发展机遇,但同时也面临着巨大的挑战。2009年4月6日,随着《关于深化医药卫生体制改革的意见》的出台,新医改给医药行业带来巨大影响。国家既要控制药物价格,又要允许制药企业获得合理回报,积极推进医药产业的发展。制药企业在基本药物价格管控下,仍要维持企业的正常运营获得利润。　　在这种情况下,医药企业可以通过降低企业税负水平来减少支出,提高利润。因此需要对我国医药企业的税收负担进行评估,并对其可能的影响因素进行论证分析。本文对国内外相关文献进行了梳理和研究,并阐述了我国医药行业的发展情况与税负水平。接下来本文研究了影响医药上市公司实际税率的因素,在理论分析的基础上,在实证研究中提出基本假设。以2006-2012年我国58家医药上市公司为样本建立了实证模型,采用描述性统计和面板数据模型,验证这些影响因素对医药上市公司实际税负的影响程度。　　实证研究结果显示,企业规模、资产负债率、第一大股东持股比例与企业实际税率呈负相关关系,盈利能力、资本密集度与企业实际税率呈显著正相关关系,其中企业规模、资产负债率、盈利能力第一大股东持股比例的影响力较为显著。从这个面板数据来分析,企业规模的实证结果在一定程度上验证了政治权利假说;资产负债率的实证结果表明医药上市公司的债务性税盾作用显著,然而资本密集度的实证结果表明非债务性税盾对医药企业没有产生显著效果;盈利能力越强的公司,实际税负水平越高;第一大股东持股比例越高,医药企业实际税负越低,说明相较于政治经济地位,第一大股东更看重股东权益,但从描述性统计结果看出国有医药上市公司的实际税率大于非国有医药上市公司。　　根据医药上市公司实际税负影响因素的实证结果,本文在最后一章分别对政策制定者和医药企业提出了相应的建议。