医学影像三维重建是目前的一个多学科交叉的研究领域，是计算机图形学和图象处理在生物医学工程中的重要应用。它涉及数字图象处理，计算机图形学以及医学领域的相关知识。近年来，医学影象三维重建可视化在诊断医学，手术规划及模拟仿真，解剖教学等方面发挥着越来越重要的作用。　　本文主要针对通过MR扫描装置获得的人脑数据集，以三维可视化技术建立一个三维数字化人脑侧脑室系统模型。主要围绕二维图象的载入，预处理和显示，三维模型的构建，以及所构建模型的简化几个方面展开研究。　　在二维图象的处理方面，主要实现对一组医学断层数据的载入，预处理，分割和浏览显示，对现有的分割算法进行了研究，在绘制上采用OPGL来绘制；在三维重建方面，研究了现有的医学图象三维重建所采用的一些方法，分析了面绘制和体绘制各自的优缺点，选取了表面绘制中的MC算法来进行三维表面模型的重建。MC算法是基于规则体数据抽取等值面的经典算法，本文实现了这种算法对人脑侧脑室二维断层数据的三维模型重建，并分析了这种算法的缺点：连接方式二义性以及重建三角面片过多重建速度慢等。　　针对这些缺点进行了相应的改进：解决二义性主要介绍了二义性平均值判定法，子构型查找表，梯度一致性准则和渐近线判别法等方法，本文主要应用了渐近线判别法来消除二义性；模型的简化主要介绍了抽样，自适应细分，删除和顶点合并等思想，本文基于这些思想实现了一种改进算法：数据预存储算法。该算法主要实现了一种有效的数据缓冲机制，对MC算法所需要载入的断层数据进行了缓冲处理，对需要重复读取的层数据预先进行存储，从而更有效的利用了存储空间，提高了绘制速度，通过实验证明在重建效果相差不大的情况下，内存占用和绘制速度都有提高。三维显示中可以实现对重建后的表面模型的绘制和显示，以及对重建后模型的浏览。论文最后综述了侧脑室系统三维重建系统的开发，分析了重建系统的程序流程，对系统进行了模块划分，能满足医学影象数据的可视化要求，并具有良好的普适性和扩展性。　　本论文也对今后的工作做了展望，为后续开发提供了软件平台。