本实验选用晋旱125×昔野501及其杂交后代共87个材料,运用SPSS、Power Marker、Structure等软件,通过相关分析、主成分分析、多元线性回归分析、聚类分析等方法,对87个材料的农艺性状、品质性状和SSR分子标记等进行分析,探讨了大豆产量和品质的理想株型,将大豆株型性状与分子标记结合,为高产优质大豆育种提供理论依据和种质材料,结果显示:1、对87个材料性状进行相关分析总结出了与大豆产量显著相关的性状,通过主成分分析,得出产量构成因子、株型因子、粒重因子、负粒重因子、株型因子Ⅱ5个相互独立的成分。2、通过对主要农艺性状与单株产量进行多元线性回归分析得出回归方程:Y=-47.205-2.453×X1+8.162×X2+4.631×X3（Y:单株产量;X1:底荚高度;X2:有效分枝数;X3:主茎节数）;通过脂肪与脂肪酸的多元回归分析得出回归方程:Y=2.135+0.596×X1-0.506×X2+0.243×X3+0.478×X4（Y:脂肪;X1:棕榈酸;X2:硬脂酸;X3:油酸;X4:亚麻酸）。3、通过对农艺性状聚类分析得出了三大高、中高、低产类群;通过对品质与单株产量聚类分析分为低产高蛋白、中高产较优质、高产高脂三类。其株型共同特点是植株高大、分枝数多、主茎节数多、底荚高度低。4、本试验根据上述统计方法,归纳出适合山西生态区的高产优质理想株,表现为:具有较高株高（92.9-96.69cm）、底荚高度（6.9-7.4cm）、较多分枝数（5-7）,较多有效分枝数（5-7）、较多主茎荚数（54-73）,主茎节数（23-27）。筛选出15个高产优质品系,分别为5、13、25、26、40、43、44、45、47、48、50、57、58、63、65,为理想株型在山西生态区应用提供了实践基础。5、15对引物遗传信息较丰富。15对SSR引物表现出了多态性,共有39个等位变异,平均等位变异点是2.6。多态信息量的变化范围是0.025～0.588,平均多态信息量是0.297。基因多样性平均值是0.349。采用SSR分子标记技术,对87个品系进行亲缘关系和遗传多样性的分析,研究结果将其分为5大类。通过对材料的遗传结构分析,将群体分为3个亚群,每个亚群数量分别为28、23、36个材料,占比为32.18%、26.43%、41.38%。