宏基因二代测序在肺部感染病原体诊断中的应用价值研究

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hongtu200909
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目的:探讨mNGS在肺部感染患者病原体中的诊断性能,分析mNGS对临床调整抗感染策略的影响。方法:回顾性分析2019年9月-2021年2月在山西医科大学第一医院呼吸与危重症医学科、重症医学科和血液科诊断为肺部感染的79例患者,这些患者均完善支气管镜检查及肺泡灌洗技术,并收集BALF同时送检传统病原学检测(细菌培养、真菌培养、抗酸染色)及mNGS。将患者分组为重症组(29例)/非重症组(50例)、合并基础肺病组(15例)/无基础肺病组(64例),通过对比mNGS和传统方法,探讨mNGS在不同分组中及不同类型病原体的阳性率和诊断性能,分析mNGS对临床调整抗感染策略的影响。结果:1.在79例患者中,mNGS阳性67例,检测到5种类型病原体、81种菌种、227株菌种。传统方法阳性38例,检测到3种类型病原体,共27种菌种、57株菌种。与传统方法对比,mNGS可检测的微生物类型更全面,检测菌种更丰富。2.与传统方法对比,mNGS可显著提高微生物的阳性率,尤其是G-细菌、真菌、结核,差异有统计学意义(P<0.05)。在非重症组、无基础肺病组,mNGS可显著提高微生物的阳性率,差异有统计学意义(P<0.05);在重症组、合并基础肺病组,差异无统计学意义。3.在肺部感染中,mNGS的敏感度为98.21%,特异性为52.17%,阳性预测值为83.33%,阴性预测值92.31%。在重症组中,mNGS敏感度为100%,特异性为46.15%,阳性预测值为48.15%,阴性预测值为100%;在非重症组中,mNGS敏感度为96.67%,阳性预测值为85.71%;在合并基础肺病组中,mNGS敏感度为100%,阳性预测值100%;在无基础肺病组中,敏感度为97.56%,特异性为52.17%,阳性预测值为78.43%,阴性预测值92.31%。在不同类型病原体中,mNGS的敏感度和阴性预测值较高。4.在肺部感染中,mNGS指导了49.36%的患者调整抗感染方案;重症组中有65.52%患者调整抗感染方案,非重症组中有40.00%患者调整抗感染方案,与非重症患者组相比,重症组患者中有更多的人调整抗感染方案,有统计学意义(P=0.029)。在合并基础肺病组的患者中有60.00%患者调整抗感染方案,在无基础肺病组中有46.88%患者调整抗感染方案,差异无统计学意义。结论:1.与传统病原学检测方法对比,mNGS可检测的微生物类型更全面,检测菌种更多、更丰富,尤其是检测苛养菌和罕见菌更占优势。2.mNGS检测微生物的阳性率明显高于传统方法,尤其是在G-细菌、真菌、结核分枝杆菌方面。3.mNGS诊断肺部感染及检测病原体的敏感度和阴性预测值较高,对微生物诊断及排除具有重要意义。4.mNGS的结果可指导临床调整抗感染策略,尤其是重症患者。
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