【摘 要】
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本文利用同源模建、分子力学和分子动力学对细胞周期依赖性激酶10(CDK10)、细胞色素P450 (CYP) 2s1 和2f1、磷酸甘露糖异构化酶(PMI)等的三维结构进行了模拟,并在模建得到的
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本文利用同源模建、分子力学和分子动力学对细胞周期依赖性激酶10(CDK10)、细胞色素P450 (CYP) 2s1 和2f1、磷酸甘露糖异构化酶(PMI)等的三维结构进行了模拟,并在模建得到的三维结构基础上进行了与相关小分子的对接研究。从模建得到的CDK10三维结构可以看出它具有一般激酶具有的特征。为了进一步研究其催化机理,我们进行了CDK10 与ATP 以及两个抑制剂(Flavopiridol,Staurosporine)的对接研究。研究了Cyp2f1、Cyp2s1 的空间结构并将他们与可能的配体——维甲酸(Retinoic acid)进行了对接,另外,还将Cyp2f1 与其可能的抑制剂3-甲基吲哚进行了对接研究。利用分子力学优化和分子动力学模拟处理同源模建得到的PMI 三维结构。利用Affinity 程序,将磷酸甘露糖异构化酶与底物(M6P)和抑制剂(AF15394、5PAH)的对接结果进行了比较与分析。
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