转基因农业生物技术迅速发展,对全球农产品价格及食物安全性产生了重要影响,并引起了人们的广泛关注。转基因生物技术是在现有资源条件下,解决人类粮食短缺,提高农产品质量的重要途径。为发展转基因农业生物技术,2008年我国启动了转基因生物新品种培育科技重大专项(转基因专项),该专项计划投入资金240亿元。本文的目标是通过对比“863计划”,“973”计划和转基因专项对转基因技术研发成果产出的影响,分析目前我国的转基因专项改革是否有更高的产出效率,为政府制定我国转基因农业生物技术的发展战略提供科学的依据。为达到上述研究目标,本文以转基因专项承担单位为研究对象,利用2010年对转基因专项承担单位的调研数据(包含研发投入和论文产出)及德温特专利数据库中的专利产出数量,通过负二项回归模型的实证分析,对比“863计划”、“973计划”,研究转基因专项改革对转基因生物技术成果产出的影响。本文的研究得出以下几点结论:(1)专项投资显著提高了我国转基因技术研发成果产出效率。(2)科技项目的考核评价标准对科技成果产出具有重要导向性作用。(3)人力资本特别是人员质量对科技成果产出为显著的正影响。(4)科研单位的知识积累是影响专利产出的重要因素之一。根据上述研究结论,本文提出几点主要政策建议:(1)坚持以专项投资为导向的科技投资模式,为科研人员提供稳定的经费来源。(2)根据不同重大专项的性质设立政策导向,转基因重大专项应以产业为导向。(3)国家应注重人才培养和人才引进,加强农业生物技术研发人才团队建设。(4)完善制度建设,建立转基因专项知识产权事务部为转基因技术产业的健康发展提供知识和技术政策保障。