【摘 要】
:
随着人类基因组工作的初步完成,一门新兴的学科也随之诞生——生物信息学,它是结合计算机技术和生物技术发展的学科,是数学、统计、计算机与生物医学交叉的学科,研究生物信息
论文部分内容阅读
随着人类基因组工作的初步完成,一门新兴的学科也随之诞生——生物信息学,它是结合计算机技术和生物技术发展的学科,是数学、统计、计算机与生物医学交叉的学科,研究生物信息的采集、处理和解释等各方面.基因识别就是重要的研究内容之一,研究基因识别具有深远的生物意义.本文主要研究基因外显子的识别问题.讨论了原核生物和真核生物的结构和识别方法,分析了外显子识别的基本原理和基本流程,对每一个识别步骤进行了研究,利用信号处理的相应方法解决外显子的识别问题.比较各种现有外显子识别算法的优劣,提出了改进算法.首先,探讨了外显子的3-周期性,研究了自相关傅里叶变换对外显子的3-周期性呈现效果的影响,利用Matlab软件编程绘制功率谱图形,发现自相关傅里叶变换可以增大具有3-周期性外显子的N/3处功率谱值.调整相邻的两个或两个以上的外显子连在一起后的顺序,通过自相关傅里叶变换绘制功率谱图,得到调整后序列的3-周期性表现效果更强.其次,分析现有数值映射方法的转化规则,将映射方法进行分类,讨论每一类数值映射对外显子3-周期性表现的影响,以及Voss,Z-curve和正四面体映像之间的关联,提出Z-curve映射下的快速算法.结合现有不同种类基因的阈值确定模型,提出两种改进模型,通过计算综合评价指标,表明改进模型较优于原阈值确定模型.最后,进行基因外显子识别,根据阈值确定模型得到不同种类基因的阈值,采用自适应窗口平移法来计算每一次平移后窗口内的信噪比,通过比较得到外显子和内含子的识别区间,以敏感性,专一性和特异性以及综合评价指标来评判算法的可行性和有效性.
其他文献
近年来,困扰广大民族电影人的一个核心问题在于:为什么现在的少数民族题材电影,不再像上世纪五六十年代的少数民族题材电影一样,具有影响全社会的功效,成为万众瞩目的经典?$$这个
为探究磷渣用作混凝土细骨料的可行性,结合混凝土搅拌站生产实际,选取C35和C60两个强度等级混凝土进行试配。研究发现:磷渣混凝土吸附减水剂,混凝土的工作性能有一定程度的损
利用移动媒体开展移动阅读推广,可以更好地发挥图书馆的阅读引领作用,而以移动互联时代的用户消费行为模型——SICAS为基础,可以构建适应当下阅读行为新变化的高校图书馆移动
在房地产企业经营管理过程中,足够的资金是项目运行的保障。但房地产企业在项目经营与开发过程中对资金需求量比较大,为了拓宽项目的利润空间,需要企业加强对资金收支的严格
目的了解该院感染病例真实数据,降低医院感染病例漏报率。方法每月加强对感染病例漏报监测,对感染病例漏报进行核实,并纳入科室医疗质量考核。结果2012年该院感染漏报率为11.01%,漏
非物质文化遗产历经文化变迁,其特有的思维方式以及审美观念等性质体现着其特有的文化价值、教育价值。它能更新当代学子的思想意识,熏陶情操,提升人文素质。本文主要包括了
目的 观察中药在治疗腹部术后肠胀气方面的效果。方法对照组行常规胃肠减压术,观察组在此基础上服用中药行气通腑汤。结果观察组总有效率97.14%,对照组总有效率50.00%。结论中药行
平均故障间隔时间(MTBF)作为产品的可靠性指标,因其表述问题直观、数学处理简单,而得到了广泛地应用。在对该指标适用性进行系统研究的基础上,发现在一定条件下,可用某一适当
随着物联网、移动互联、智能终端的广泛应用,农业跨步迈入大数据时代,工业4.0的兴起,间接带动农业4.0的快速发展,农业大数据逐渐上升到更高层次。在此背景下,本文从水产大数
体育游戏,是培养学生全面发展的一种教学手段,是学校教育中的一个重要组成部分。通过学生的心理和生理特点来看,体育教学在小学教育中往往比其他学科更为重要。因此,体育游戏