东北雨蛙(Hyla japonica)隶属于两栖纲(Amphibia),无尾目(Anura),雨蛙科(Hylidae),雨蛙属(Hyla),在我国主要分布于内蒙古和东北三省,在国外主要分布于朝鲜半岛,韩国、日本及俄罗斯等地。目前,国内外关于东北雨蛙遗传多样性的研究较少,国内的研究主要集中在东北雨蛙生理生化与细胞遗传等方面;国外有韩国学者对朝鲜半岛分布的东北雨蛙与水原雨蛙(H.suweonensis)遗传多样性的比较分析。本文通过对14个地理种群的87个东北雨蛙(包括在Genbank上下载的朝鲜半岛的本种同源序列)线粒体DNA的研究,探讨了其种群遗传多样性及系统分布格局。经PCR扩增和测序后,获得了845bp的cyt b区基因序列。整个东北雨蛙种群的单倍型多样性(h)为0.824,核苷酸多样性(π)为0.00658,无论是与同属其他雨蛙还是与其他属蛙类相比较,东北雨蛙种群遗传多样性都相对较低。整个内类群cyt b区基因存在41个变异位点,包括31个简约信息位点;共定义了31个单倍型,其中种群间共享单倍型是5个,种群内共享单倍型是6个,特有单倍型是20个;碱基间转换颠换比为8.32;种群间遗传距离为0~0.012,平均遗传距离为0.008。基于单倍型在种群中的分布、系统树的拓扑结构与单倍型网络支系分析,研究表明整个东北雨蛙种群分为两支,其中一支均由朝鲜半岛的部分单倍型构成,另外一支则是没有明显的地理分布结构。整个东北雨蛙种群的单倍型都没有形成显著的地理分布格局。推测可能是由东北雨蛙自身生活特征以及东北地区没有明显地理屏障所导致的。成体的东北雨蛙种群扩散和迁移能力可能较强,导致东北三省不同地理居群包括与朝鲜半岛居群间的基因交流较为频繁;东北地区地势主要以平原为主,河流密布而且贯通,高山与河流均未对东北雨蛙种群形成地理上的隔离,各种群之间的基因交流比较容易发生。在东北雨蛙样品采集的过程中,发现其种群数量呈现下降趋势,需要加强这一物种的调查和监测工作。东北雨蛙种群的栖息地结构类型单一,多样性程度低,部分栖息地由于人为活动的影响,破坏现象严重。研究结果也表明,东北雨蛙种群的遗传多样性(核苷酸多样性与单倍型多样性)较低,所以,我们认为应该加强对东北雨蛙种群的关注与保护。