随着我国城镇化和工业化的快速推进，城市建设用地资源日益稀缺，土地市场对集体建设用地需求进一步扩大，导致农村集体建设用地的资产价值日益显现，目前各地的集体建设用地的流转已经普遍客观存在。相较于迅速发展的流转实践，国家在集体建设用地流转方面的相关法律法规的制定和理论研究稍显滞后，导致我国在土地合理利用、农民利益保护、和谐社会建设等方面出现诸多问题。因此，如何科学把握农村集体建设用地流转的内在运行机理，判定集体建设用地能否流转，寻找流转关键环节，以及如何从制度上规范集体建设用地流转是当前迫切需要解决的问题。本文基于实地调研和大量研读相关文献的基础上，对农村集体建设用地流转问题进行全面研究，并针对问题提出构建健康农村集体建设用地流转市场的优化路径。以期为政府科学有效管理集体建设用地流转提供理论依据和政策建议。本文主要研究结论如下：　　（1）通过建立三方博弈模型分析可知：集体经济组织（农户），用地企业及地方政府三方经过多次反复博弈，最终的混合战略纳什均衡为：转出集体建设用地、转入集体建设用地、允许集体建设用地流转。所以放开集体建设用地流转是社会经济发展的必然趋势。　　（2）通过对比研究发现，重庆市北碚区和广东深圳市南山区，在农村集体建设用地流转方面。存在以下共同问题：私下流转现象普遍，极易引起纠纷；流转主体不明确，经济关系复杂；流转收益分配机制不完善；擅自改变土地利用性质和土地无序利用现象严重；缺乏有效的制度和监督。而差异性表现在北碚区农户流转意愿强烈，但顾虑较大；流转规模偏小；其次为中介组织不够健全。而南山区表现在农民对土地自我开发意愿强，不愿意流转；土地流转难度高，影响城市功能发挥；流转中寻租问题突出，村民利益受损。　　（3）根据实地调研数据、相关统计资料和专家评价资料，通过 AHP-模糊评价法，根据市场活跃程度、制度完善程度、市场服务体系、监管有序程度四个准则层，对两地农村集体建设用地流转市场健康程度做出评价。南山区在集体建设用地流转市场健康程度优于北碚区；影响集体建设用地流转的主要影响因素为：流转主客体是否明确，土地价值大小，利益合理分配、统一市场的建立等几个方面。　　（4）在符合规划、符合农用地专用年度计划、依法报批、占补平衡等系列原则指引下，构建健康的农村集体建设用地流转市场，完善流转市场服务体系，监管体系。