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在高等植物中,重复序列是评估基因组复杂度的关键因素,同时重复元件在基因表达、基因调控及基因组进化上扮演着重要角色。普通小麦基因组是植物界中最庞大、最复杂的基因组之一,其重复序列含量达到80%-90%。开展小麦的重复序列研究对揭示普通小麦基因组起源、进化及变异均具有重要意义。本研究利用小麦7号染色体组(7A、7B和7D)三条染色体的探查序列(survey sequences),对其重复元件组成、含量和丰度进行了分析。主要取得的结果如下:1.7AL、7AS、7BL、7B5、7DL、7DS染色体臂的序列总长分别为252Mb、198Mb、259 Mb、257 Mb、206 Mb、222 Mb、209 Mb,利用RepeatMask工具分析发现这6条染色体的重复序列含量分别为 69.17%、65.47%、64.65%、70.64%、62.36%和62.78%。整体上,RNA转座子的含量是最多的,约占总数的80%,其次是DNA转座子,约占总数的19%,其余的为串联重复序列或者未知的重复元件,占1%;转座子元件(TE)的构成类型上分析,在所有TE家族中,Gypsy类元件最多,其次是Copia和G4CTA类,这与前人报道的单子叶植物TE元件的组成特性是一致的;从各家族的丰度分析,在所有家族中只有Fatima、Jorge、Sabrina家族的含量超过10%,其余的均是大量含量较低的家族,在7A、7B、7D上共总长最长的10个家族中有7个是共有的:Angela、Jorge、Fatima、Romani、Sabrina、WHAM、Wilma,而Horace是7B特有的,Dario、E.Coli和Splet 1 是7D特有的。2.利用探查序列分析7号染色体组中一类特殊的微小倒转重复转录因子(MITE)Stowaway-like MITEs的种类、数目及变异。结果分别在7A、7B、7D找到16、17和17个MITEs家族总计2026个插入片段。相较于已鉴定的18个MITE家族,7A缺失了其中的Jason和Phoebus两个家族,7B缺失了Jason家族,而7D则缺失了Polyphemus家族;进一步对其丰度分析发现,在7A、7B、7D上分别找到587、714、725个MITE元件,7D的数量比7A和7B多,这一变化规律符合小麦进化的过程,暗示MITE在小麦多倍化过程中可能发挥了一定的作用;同时,我们还分析了这些MITE元件插入片段的核苷酸多样性指数(Pi),结果发现7号染色体组MITE元件的Pi值显著地比前人研究的高,这与测序方法和MITE序列筛选的标准有关。3.最后,我们根据MITE保守序列设计开发了6对MITE标记的引物,并在30份不同小麦及其近缘种材料进行了PCR扩增,验证其工作效率和多态性。结果,6对引物均能扩增出条带,但只有两对引物检测到多态性,表明MITE可用于开发多态性分子标记,并用于小麦属材料的遗传多态性及群体遗传学研究。本研究首次在染色体/染色体臂水平上对普通小麦的重复序列进行分析,系统的鉴定了小麦7号同源转化群上的重复元件类型和数目,并特别地鉴定分析了 Stowaway-like MITEs家族的元件以及其变异。这些研究成果对于小麦重复序列的研究、基因组序列分析以及进化都具有重要的意义,所开发的MITE引物亦可以用于重复序列研究或者群体进化研究。