皮肤毛囊基因调控网络的初建及其在绒山羊上的功能预测

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对绒山羊皮肤毛囊的研究将有助于进一步了解绒毛生长的分子调控机理,这已经成为绒山羊研究的核心和关键。本研究通过文献挖掘查找与毛囊生长发育相关的候选基因,建立毛囊发育相关分子数据库,用自然语言处理的方法对数据库中的分子进行了相关性分析,进而构建了毛囊发育基因调控网络, Pajek可视化网络后又用图论的方法进行了初步分析,并进行了其在绒山羊绒毛生长机理研究中的功能预测,结果如下:1在与毛囊发育相关的分子数据库中,共包含分子215个,其中Wnt、TGF-β、MAPK、Shh、JAK-STAT和Notch信号通路的分子分别占到分子总数的13.95%、10.23%、19.53%、3.72%、2.87%和1.40%。2对网络图的分析结果表明:1)网络中节点的重要性排在前10位的分子是:IL2/3/4/6、TNF-α/Eda、Ca2+、TGF-β、GRB2、JNK、β-catenin、TrkB/C、TCF/LEF、Zic2,其中GRB2、Ca2+和Zic2前人研究相对较少,据网络图推测可能GRB2在毛囊的生长发育过程中发挥着至关重要的作用,Ca2+在介导分子及通路间信号的传导中发挥桥梁作用,而Zic2常作为领导者执行生物功能。2)有六个信号通路在毛囊的生长发育过程中起着重要作用:它们是:Wnt、TGF-β、MAPK、Shh、Notch和JAK-STAT,一般情况下,MAPK常作为执行者来发挥作用,TGF-β信号通路常作为领导者来激活其它信号通路, Wnt则起协调作用,而Shh、Notch和JAK-STAT几个信号通路起着协调的微调作用。3)该网络和大多数生物网络类似,属于无尺度网络。
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