背景和目的随着抗病毒治疗（ART）的普及和治疗时间的延长,艾滋病病毒（HIV）耐药的问题日益突出。HIV分子网络研究有助于发现HIV-1传播特征和重点人群。钦州市作为广西艾滋病疫情严重的城市之一,还缺乏针对HIV-1感染者的治疗前耐药和分子网络的系统性研究。本研究以钦州市未进行抗病毒治疗的HIV感染者作为研究对象,开展治疗前耐药和HIV分子网络的相关研究,旨在了解钦州市未治疗HIV-1感染者的耐药情况、HIV-1传播、高危传播者和重点传播簇等方面的特征,为钦州市的艾滋病防治活动、优化治疗方案和精准干预艾滋病传播和流行提供基本信息,以减少耐药毒株的传播和产生,降低艾滋病新发感染率。方法2017-2018年,采用方便抽样方法在钦州的县/市疾病预防控制中心和医院招募518例未进行抗病毒治疗的HIV-1感染者。对感染者进行问卷调查收集人口和行为学信息,同时采集患者外周静脉血,分离血浆和血细胞。提取血浆病毒RNA,巢式PCR扩增HIV-1 pol基因区（包括蛋白酶和逆转录酶区）,将扩增成功的产物进行测序。获得的pol基因区序列上传美国斯坦福大学耐药数据库（https://hivdb.stanford.edu/）进行基因型耐药分析,用MEGA软件构建系统发育树判断HIV-1亚型,并且用Cytoscape软件构建序列基因距离小于1.5%的分子网络。采用Maxim HIV-1 Limiting Antigen Avidity EIA试剂盒检测新发感染（感染时间0.75）。高危传播者以年龄≥50岁（64.3%）、确诊时长≤1年（64.3%）和钦州市区来源（78.6%）等特征为主。有42.9%（6/14）的高危传播者存在高危行为（包括商业/临时性行为和共用注射器）。4.活跃分子簇分析:传播网络中有11.5%为新近感染者。有6个活跃分子簇,包含20个节点。其中,有1个网络包含7个新近感染者,均来源于市区且年龄大于等于50岁,其余5个网络每个均仅有1个新近感染者。活跃分子簇中,年龄以≥50岁为主,占80.0%,样本来源地区以市区为主,占65.0%;25%的患者近1年有商业性行为,15%的患者近1年有临时性行为。5.进展簇分析:有5个包含大于等于10个节点的大簇和1个活跃分子网络为动态扩增的分子簇,即进展簇。在最大最原始的进展簇中,HIV-1感染者以年龄小于50岁（82.1%）、来源于灵山（82.1%）、男性（96.4%）、自报告通过注射吸毒感染（67.9%）、确诊时间大于4年（57.1%）特征为主;其余5个动态进展簇患者以年龄≥50岁（67.1%）、来源于市区（67.1%）、男性（65.7%）、自报告通过异性性行为感染（92.9%）、确诊时间≤1年（81.4%）的特征为主。6.多因素分析:年龄<50岁是治疗前耐药的危险因素（OR=2.421,95%CI:1.131～5.181）;治疗前耐药是入网的保护因素（OR=0.483,95%CI:0.245～0.951）,年龄≥50岁是入网的危险因素（OR=1.922,95%CI:1.312～2.816）;灵山来源是大簇形成的危险因素（OR=1.864,95%CI:1.034～3.362）;来源于市区（OR=2.157,95%CI:1.083～4.295）是HIV-1感染者在分子网络中连接度≥5的危险因素。结论1.钦州市HIV-1亚型以CRF01＿AE和CRF08＿BC为主,有未知重组亚型出现。2.钦州市HIV-1感染者的传播性耐药呈低度流行;治疗前耐药呈中度流行。耐药程度和类型以低度耐药和单一耐药为主;中高度耐药患者以耐同类2种及以上药物为主。年龄<50岁是治疗前耐药的危险因素。3.钦州市在艾滋病防控方面可重点关注具有高危行为史、居住在钦州市市区、年龄大于等于50岁、新报告和非农职业等特征的人群。