【摘 要】
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目的 探究内质网应激反应(endoplasmic reticulum stress, ERS)也称为未折叠蛋白效应(unfolded protein response, UPR)激活后小鼠成纤维细胞的长链非编码RNA (long noncodin
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目的 探究内质网应激反应(endoplasmic reticulum stress, ERS)也称为未折叠蛋白效应(unfolded protein response, UPR)激活后小鼠成纤维细胞的长链非编码RNA (long noncoding RNA, lncRNA)表达谱。方法分离13天的小鼠胚胎获得并且培养小鼠胚胎成纤维细胞(mouse embryonic fibroblasts, MEFs),采用内质网应激反应诱导剂衣霉素(tunicamycin, Tm)分别处理细胞4、8、12、16和24小时发生UPR并用PCR检测其激活情况;以未处理的MEFs作为阴性对照,采用基因芯片技术检测MEFs中lncRNA在UPR激活的不同时间点的表达谱并进行生物信息学分析;使用实时荧光定量PCR验证实验结果;添加UPR小分子抑制剂的方法探究UPR不同通路对这些lncRNA的影响。结果 与未使用Tm处理的MEFs相比,Tm诱导的MEFs在16h时有411个lncRNAs表达显著上调,790个lncRNAs出现显著下调;Real-time qPCR验证部分lncRNA表达情况与芯片结果一致;生物信息学分析UPR激活后表达显著改变的lncRNA可能参与了细胞质中的细胞代谢和蛋白转运定位功能;n416682是一个在细胞浆中大量存在的基因间长链非编码RNA,其表达受到了UPR中PERK通路的影响而下调。结论 小鼠成纤维细胞的内质网应激反应激活后,细胞中的许多lncRNA的表达水平发生了改变;生物信息学分析提示这些lncRNA在UPR激活的细胞中发挥重要的生理作用。
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