由于历史和现实诸多方面的原因，我国中央及地方政府举办的大学独立办学的法人地位至今尚未完全建立，仍然没有摆脱作为政府附属机构的地位，在财务治理方面还存在很多问题。然而，大学改革趋势不可逆转，高等教育大众化和全球化以及大学快速发展的现实状况等，都亟待大学财务治理的不断完善，因此大学财务治理正逐渐成为政府、教育界、会计界、微观金融等研究的重点领域。本研究立足于公司财务治理的基本理论——委托代理理论、利益相关者理论、公司财务理论，结合这些理论的基本内涵，从公司治理（公司治理结构中体现着一系列的经济关系——出资者和经营者，管理者和监督者）推导出了大学治理（存在同公司治理类似的经济关系），并由此引申出了大学财务治理的基本概念及本质属性，系统探讨了大学财务治理模式和基本机理。研究的具体章节安排如下：绪论。首先从国内外大学的相关背景研究出发，提出了研究的背景及依据。本文采用的是多学科综合研究方法,通过确定研究范围和对象，明确提出我国大学财务治理必须不断完善。第一章，大学财务治理的理论基础及相关研究文献。第二章，基于高校财务治理决策权结构解析的决策组织机构模式创新设计。首先是对我国高校财务治理结构缺失进行分析。其次介绍美国和日本高校财务治理决策组织机构模式以及基于高校财务治理问责机制的决策程序设计——党委书记兼任主席的董事会财务治理决策机构模式设计。第三章，基于高校财务治理执行权结构解析的执行组织机构模式创新设计。首先，分析我国高校财务治理执行结构风险因素。其次，介绍美国和欧洲高校财务治理执行结构风险控制模式以及基于高校财务治理问责机制的执行程序设计——校长负责的教代会财务治理执行机构模式设计。第四章，基于高校财务治理监督权结构解析的监督组织机构模式创新设计。首先，对我国高校财务治理监督结构缺失进行分析。其次，介绍美国、欧洲和澳大利亚高校财务治理监督结构模式以及基于高校财务治理问责机制的监督程序设计——教代会为主导的监事会财务治理监督机构模式设计。最后简要介绍我国大学财务治理的控制模式和绩效评价体系。最后是结论。以上述分析研究作为基础，归纳、总结出我国大学财务治理模式设计，并针对本研究的不足之处提出未来需探讨解决的问题。