基于模式识别的NMR手性分析及mRNA与Lin28蛋白的识别位点研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kingstarKS
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近年来,Anslyn教授利用模式识别技术结合比色和荧光指示剂在手性化合物对映体组成识别分析方面取得巨大的成功。受到他的启发,我们利用普通、廉价和常见的手性辅助试剂来不同程度地诱导扰动羧酸对映异构体的化学位移,并结合模式识别技术分析对映体组成,取得了较好的结果。本部分研究利用常规的手性辅助试剂诱导识别手性羧酸和胺的对映异构体的组成比例。该方法有以下优点:1、试剂简单普通,不需要特别设计合成呈特异性的复杂试剂;2、不需要衍生化,避免了试剂浪费;3、不需要一般溶剂化试剂所必需的将手性异构体的核磁共振信号分裂达到能准确积分的程度,这为现有的手性溶剂化试剂应用范围扩展提供新的思路。   RNA结合蛋白Lin28在人类和老鼠的胚胎干细胞中高度表达,在正常的组织中表达少,而在各种与疾病相关的恶性组织中高表达。目前有一些与Lin28结合的mRNAs已经被发现,但是,可被Lin28识别的具有特定功能的具体结构的特征和序列还未被阐明。   本课题利用生物信息学结合体内原位的荧光素酶报告基因检测和体外凝胶阻滞实验筛选和鉴定一系列mRNAs(oct4,hmga1,和rps19.)被Lin28特异性识别的共性结构序列,它们具有相类似的结构特征。从而发挥Lin28促进其mRNAs的翻译功能。这个结构的特征是含有一个茎状A和两个茎环型的(Stem-loopsBandC)的结构,而且带有一个突出的被一对g:c碱基对包夹的“a”。同时还证实了Lin28△C突变体对靶mRNAs的翻译和(l)et-7miRNA的合成具有不同的功能。而产生这种不同的功能是由于Lin28在结合各种RNA(包括mRNAs和miRNAs)的同时还招募了不同辅助因子引起的。这些结果为Lin28识别mRNAs提供了分子机制,这些机制在干细胞和癌细胞中理解Lin28如何调节翻译是十分重要的。
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