基于生物信息学探讨多溴联苯醚与宫颈癌的关系

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目的:探讨内分泌干扰物(Endocrine disruptors chemicals,EDCs)多溴联苯醚(Poly brominated diphenyl ethers,PBDEs)与宫颈癌及其癌前病变的关系。方法:纳入2021年1月至2021年11月就诊于新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第三附属医院和五家渠市第六师医院,诊断为宫颈癌(Cervical cancer,CC)、高度宫颈上皮瘤变(High cervical epithelial neoplasia,CIN)、宫颈正常者,共133名研究对象。采用问卷调查的方式,收集研究对象一般人口学信息、生活习惯、生殖情况、既往病史资料等相关CC/CIN影响因素。采用气相色谱-质谱联用仪测定血清中八种PBDEs同系物暴露水平。利用比较毒理基因组学数据库(The Comparative Toxicogenomics Database,CTD)收录的PBDEs暴露相关基因,利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)及基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus data base,GEO)下载CC及CIN转录组数据,筛选建立PBDEs暴露-CC/CIN共表达基因组;对PBDEs暴露-CC/CIN共表达基因进行富集分析、Mcode分析、生存分析、免疫浸润分析、HPV相关基因的相关性分析。利用转录组测序以及免疫组化验证共表达基因表达情况。结果:1.CC/CIN影响因素分析结果显示:HPV感染OR(95%CI)=193.060(25.275-1474.7)是影响CIN和CC发展的共同危险因素;节育器使用史OR(95%CI)=34.345(1.169-1009.106)是影响CC发生的危险因素。2.PBDEs暴露水平:本研究纳入133例研究对象血清中PBDEs暴露量较低,尚未达到此次检测水平。3.PBDEs暴露与CC/CIN共表达基因:BDE-47暴露与CC有关基因个数最多,达213个;BDE-209暴露与CC有关基因包含93个、BDE-99暴露与CC有关基因包含19个;BDE-183暴露与CC有关基因包含7个;BDE-100暴露与CC有关基因包含7个;BDE-28、BDE-154、BDE-153暴露与CC有关基因最少,分别包含2、1、1个。BDE-47暴露与CIN有关基因个数最多,达133个;BDE-209、BDE-99、BDE-183、BDE-100暴露与CIN有关基因个数分别为49、14、1、1个;BDE-28、BDE-154、BDE-153暴露与CIN有关基因个数为0。4.PBDEs暴露-CC/CIN变共表达基因参与通路:BDE-47暴露可能与CC/CIN中有丝分裂、细胞周期、DNA损伤、p53信号通路、癌症通路等途径有关;BDE-209暴露可能与CC/CIN中有丝分裂、细胞周期、p53信号通路、PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路、癌症相关通路有关;BDE-99暴露可能与CC/CIN中PI3K-Akt信号通路、Wnt信号通路、癌症中的蛋白多糖等通路有关。5.PBDEs暴露-CC/CIN共表达基因与宫颈癌患者预后有关,且与多种宫颈癌免疫浸润性细胞存在相关性。6.PBDEs暴露-CC/CIN共表达基因与HPV E6/E7相关基因表达存在相关性。7.验证实验:转录组测序及免疫组化验证结果与公共数据库数据挖掘结果基本一致。结论:PBDEs暴露与CC及其癌前病变存在一定的关系;不同的PBDEs同系物可能对CC的发展发展的影响不一;PBDEs对CC及其癌前病变的影响可能与HPV感染有关。
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