我国作为由计划经济向市场经济转型的国家，在产业组织领域存在着迥异于发达国家的特点。现阶段，在我国大多数工业行业中既有国有企业又有民营企业，产权结构复杂。因此简单套用西方产业组织理论去研究中国的产业组织，会因忽略掉关键变量而对中国在转型背景下特有的产业现象缺乏解释力。本文在对既有产业组织理论、产权理论与国内相关研究文献回顾与梳理的基础上，把产权结构因素作为一个变量纳入到产业组织的框架内；分别论述了引入产权结构的必要性，产权结构对企业行为的影响,不同性质的产权所决定的不同的企业行为对市场绩效的影响；并应用古诺双寡头模型进行严密的数理论证；最后形成了产权结构-企业行为-市场绩效的分析框架。在实证部分应用2005-2007年中国工业统计数据，建立多元回归模型对上述理论范式进行实证分析，得到了与理论分析相吻合的结果。无论是理论模型的推导结果还是数据实证都证明了在现阶段，从整个产业角度而言，国有产权具有负面的、降低资源配置效率的经济效果，它给整个经济带来的不利作用已经成为影响中国经济发展和效益提高的重要阻碍因素，私营经济从整个产业角度而言比国有企业有着更高的效率。因此，本文认为在现阶段国有企业退出与市场失灵和公共产品提供无关的行业领域，并放宽民营资本的进入门槛，可以改善资源配置效率。