DUS4L基因在肺腺癌中的表达及其作用机制的探讨

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第一章基于公共肿瘤数据库分析DUS4L基因在肺腺癌中的表达及其临床意义背景:肿瘤仍然是世界上最具挑战的公共卫生问题之一。最近过去的数年来,各个国家的肺腺癌的发病率呈现出不断上涨的势态,现在已成为肺癌中最为多见的病理学类型。公共癌症数据库TCGA为科研人员能够快速、精准地获取不同肿瘤的基因组学数据,发现肿瘤防治相关的新靶点提供了很好的途径。目的:本次研究中我们使用生物信息学技术分析TCGA数据库肺腺癌患者样本中表达异常的基因组学数据,并选出其中具有研究和临床应用价值的靶基因。方法:检索TCGA数据库中肺腺癌患者样本的转录组测序数据及临床病理信息文件,在对癌与正常组织之间表达水平存在差异的基因进行筛选后,我们最终确定了所要研究的目的基因,之后将目的基因的表达水平与肺腺癌患者临床信息进行分析,确定之间的相关性。结果:研究发现类二氢尿苷合酶4(Dihydrouridine Synthase 4 Like,DUS4L)在肺腺癌组织中的表达水平较正常肺组织明显升高。DUS4L基因表达水平在不同T分期和病理分期的患者肿瘤组织中具有显著差异性(P<0.05),并且与患者T分期和病理分期呈正相关(P<0.05)。结论:DUS4L基因在肺腺癌组织中表达水平随着肿瘤体积的增大以及患者病理分期的增加而升高。第二章DUS4L基因对肺腺癌细胞功能影响的研究背景:有研究表明DUS4L在胃癌、前列腺癌等恶性肿瘤中异常表达,但是目前尚无DUS4L基因参与肺腺癌发生发展的相关研究报道。目的:通过慢病毒介导的方法感染并敲除肺腺癌细胞中DUS4L,观察DUS4L基因敲除对肺腺癌细胞增殖、凋亡、克隆、周期等产生的影响,阐明DUS4L基因在肺腺癌发生发展过程中所起到的生物学功能。方法:首先通过慢病毒感染肺腺癌细胞建立DUS4L敲除的细胞模型,然后通过Celigo细胞计数实验,细胞凋亡实验,细胞周期实验、克隆形成实验等,观察DUS4L敲除对肺腺癌细胞增殖、周期和凋亡所产生的影响。结果:较基因阴性敲除肺腺癌细胞相比,DUS4L基因敲除后肺腺癌细胞增殖能力显著收到抑制,细胞凋亡率显著增高,细胞克隆形成减少,细胞周期发生明显变化,以上结果均具有显著差异(P<0.05)。结论:肺腺癌细胞中DUS4L基因的表达缺失可以影响细胞周期进程,抑制癌细胞增殖与克隆形成,促进细胞凋亡。DUS4L基因有望成为肺腺癌靶向治疗中的新靶点。第三章DUS4L基因作为肿瘤驱动基因的机制探讨背景:前期研究发现敲除肺腺癌细胞中DUS4L基因可促进了肿瘤细胞凋亡,抑制肿瘤细胞增殖和克隆形成,并且影响肿瘤细胞周期进程。但DUS4L作为肿瘤驱动基因的可能机制尚未明确。目的:本研究采用转录组测序(RNA-seq)技术观察DUS4L基因敲除前后基因表达谱的变化,并对差异表达基因进行功能富集分析,探讨DUS4L参与肺腺癌发生发展的可能机制。方法:首先利用慢病毒感染肺腺癌细胞建立DUS4L基因敲除细胞模型,并采用转录组测序(RNA-seq)技术观察DUS4L基因敲除前后基因表达谱变化,然后对差异基因进行通路富集分析。结果:DUS4L基因敲除后,肺腺癌细胞基因表达发生改变,共有5011个基因被显著调控,其中包括2206个基因上调,2805个基因下调。对差异基因集进行GO和KEGG通路富集分析后发现,差异基因主要集中在剪接体、核糖体、RNA分解代谢、非编码RNA、P53等信号通路。结论:肺腺癌细胞中DUS4L基因可调控大量基因的表达,为进一步研究DUS4L在肺腺癌发生发展中的作用机制提供了新的线索。
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