社会系统是社会科学的重要研究对象。社会现象中可以被经验证实并且可以科学化的部分是证明社会问题科学化合法性的现实依据。将社会科学作为研究对象进行分析,其所要面对的现实客体是社会系统。社会科学具有和自然科学同等的解释力,不仅揭示出各种社会现象的成因,而且在自身科学化的过程中得出了关于社会系统其发展规律的认识。与自然科学相比,社会科学的研究的对象是普遍具有高度复杂性和特定历史性的社会事物或社会历史现象。社会现象在产生发展的过程中都具备自组织、自发展的能力,不仅在性质和结构上体现出复杂性,而且受众多自然和社会变量的制约,而这些变量之间往往又是彼此相关的,具有非线性、自组织的关系。相对于传统机械观与还原观分析方法而言,非线性、自组织问题的复杂性程度大大增加,因此采用传统的分析方法愈发显现出认识与研究的局限性,因此我们必须采用新的思路与方法对社会科学中的自组织元理论问题进行研究。在科学主义与人本并重的当代社会,伴随着科学理论的不断发展,自组织问题逐渐体现出其重要性：它带有跨学科性质,涉及到几乎所有的学科层面。社会系统的结构由基本元素组成,不需要外界能量或信息的输入便可以自发的进行组织和动力学进化,即自发的从无序走向有序,这个过程与非线性机制密切相关,强调了系统对初始条件的敏感性和该系统表现出不连续的行为的能力,并且寻求“解释在最初的混乱状态中系统所出现的有序的行为模式”,试图解释源于混沌而出现的有序。社会系统的自组织现象普遍存在,并且与自然系统的关系相当密切。在研究社会系统的过程中,一方面为把握自然科学理论提供了新的研究视角,另一方面从新的基本概念和理论方法出发,去探究社会系统形成和演化的基本规律,对分析概括社会科学中的自组织现象具有启迪意义。但是在当前的理论探索领域中,对自组织问题的研究和应用主要局限在物理科学、生物科学等自然科学领域,而在其它领域,特别是在社会科学研究层面,其研究内容还主要局限在定性的层面,我们仍需去加强定量分析和建立模型的研究方式。因此本文立足于对具有自组织性质的社会科学理论的基本内容进行阐释,理解社会科学的性质和运行方式,在充分奠定其哲学基础的前提下对社会科学的自组织问题的本体论、认识论和方法论的意义进行细致分析。