中国近海和北极表层海水细菌多样性及胞外酶活性研究

来源 :山东大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:michelle77
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
海洋是地球上最大的生态系统,地球表面约71%的面积被海洋覆盖。海洋中蕴含着大量的生物资源,尤其是微生物资源,但目前仍有许多海洋微生物未被发现与挖掘。作为海洋环境的重要组分,微生物不仅具有丰富的物种多样性和出色的环境适应性,还可以通过产生相应的胞外酶使得高分子量有机物降解为能够被转运利用的小分子物质,参与并影响海洋有机物循环过程。而目前还没有对东海及黄海海域原位胞外酶活的详细报道,特别是高分子量底物,其胞外酶分布模式、种类及影响因素尚不清楚。另外,对北极可培养细菌胞外酶活性的报道也相对较少。本论文针对以上问题分别对中国近海和北极海域表层海水中细菌多样性和海洋胞外酶活性进行了较为详细地研究,并且对一株分离自南海表层海水的细菌进行了系统的多相分类学研究,最终明确了该菌株的分类学地位。1.中国南海表层海水可培养细菌多样性分析及Parvularcula marina SM1 705T多相分类研究通过对南海表层海水样品中可培养菌株的分离鉴定,研究该环境下的物种多样性。该样品中的可培养细菌主要属于Actinobacteria和Proteobacteria门,其中Microbacterium、Erythrobacter及Parvularcula属为优势种群,分别占全部可培养菌株的23.7%、7.9%和6.2%。另外,从该表层海水样品中分离得到一株新菌,编号为SM1705。菌株SM1705是一株异养且好氧的革兰氏阴性菌,其细胞呈短杆状,黄色,有鞭毛。该菌株的生长温度范围为10-40℃,最适的生长温度为35℃;其生长的NaCl浓度范围是0.5-13%(w/v),最适的NaCl浓度为1%;其生长的pH范围是6.0-9.0之间,最适的pH为8.0。菌株SM1705的主要脂肪酸是Summed feature 8,C16:0和C18:0。该菌株的主要极性脂包括三种未知结构的糖脂(three unidentified glycolipids,GL1-3)及一种未知结构的脂类(one unidentified lipid,L1)。菌株SM1705T的细胞基因组DNAG+C含量为59.3%。菌株SM1705与Parvularcula属中的成员Parvularcula bermudensis相似度最高,为96.0%。基于16S rRNA基因序列的系统发育树显示菌株SM1705与P.bermudensis、P.oceani、P.lutaonensis、P.dongshanensis 和 P.flava 集结成簇,同时其又形成了一个独立的进化分支。基于以上的多相分类学数据,菌株SM1705代表Parvularcula属中一个新种,命名为Parvularcula marina sp.nov.,菌株 SM1705T(=KCTC 26795T=MCCC 1K03505T=CCTCC AB 2018345 T)。2.中国黄海、东海表层海水原位酶活分析通过对黄海及东海海域中不同站点处表层海水原位酶活的测定,分析了该海域表层胞外酶的分布模式、种类及影响因素。在总胞外酶活性中,磷酸酶和酪蛋白酶显示出较高的活性,表明二者对于海洋生态系统中磷、氮元素的循环具有重要的作用。虽然α-葡萄糖苷酶和β-葡萄糖苷酶都能通过水解低聚糖释放单糖,但β-葡萄糖苷酶的活性远高于α-葡萄糖苷酶,这说明了 β-葡萄糖苷酶在海洋碳循环过程中发挥重要作用。对游离胞外酶活性而言,酪蛋白游离酶活性最高,其次是几丁质酶、纤维素酶及褐藻胶裂解酶游离酶,而磷酸酶、β-葡萄糖苷酶及N-乙酰-β-葡萄糖苷酶游离酶活性与总酶活相比均有所减弱,这表明酪蛋白酶及多糖水解酶多为游离酶,其他相应的酶可能是细胞或颗粒附着酶。近岸海域,尤其是近河口海域,与离岸海域相比原位胞外酶具有更高的活性,其主要受叶绿素a、盐度及PO43-含量所驱动。此外,原位胞外酶活性与该环境中的微生物种群结构也有一定的联系,本章中测到的较高的酶活性可能与Roseobacter、Alteromonas 和 Pseudoalteromonas 属有关。3.北极表层海水可培养细菌多样性分析及部分菌株产酶能力研究通过分离鉴定北极表层海水样品中的可培养细菌来研究该样品中的细菌多样性。结果发现,该样品中的可培养细菌主要属于Bacteroidetes和Proteobacteria门,相对应的Cellulophaga和Pseudoalteromonas属为优势种群。通过对不同底物的降解实验发现63%的实验菌株具有降解高分子量底物的能力。在这些细菌中,65%的菌株可以降解酪蛋白,这些产蛋白酶菌株主要属于Pseudoalteromonas属;35%的菌株能够降解纤维素,其中Lacinutrix属占绝对优势;71%的菌株具有降解褐藻胶的能力,这些产褐藻胶裂解酶酶的菌株主要属于Pseudoalteromonas和Lacinutrix属;29%的细菌具有降解淀粉的能力,这些产淀粉酶的菌株主要属于Pseudoalteromonas属;而产几丁质酶和酯酶的菌株是Aeromonas及Cellulophaga属。同时根据基因组胞外酶注释分析,发现在此样品中能够降解多种底物的可培养菌株主要属于Aeromonas、Cellulophaga和Pseudoalteromonas 属。4.Cellulophaga sp.SM-W46在不同培养温度下的胞外酶活性研究Cellulophaga sp.SM-W46是一株可以降解酪蛋白、纤维素和几丁质等多种底物的细菌。利用聚球藻Synechococcus sp.PCC7002的细胞裂解液作为培养基,以C.sp.SM-W46作为研究对象,通过测定在不同培养温度下的胞外酶活性来研究温度对该菌株所产的胞外酶活性及种类的影响。本章利用荧光小分子模拟底物检测到了五种胞外酶活性,其中亮氨酸氨肽酶活性最高,磷酸酶、几丁质酶及糖苷酶活性较低。通过检测游离酶活性,发现磷酸及酪蛋白游离酶活性与总胞外酶活性相比差异较小,几丁质游离酶活性与总酶活相比有所降低,β-葡萄糖苷游离酶活性甚至无法检测到,猜测磷酸酶与酪蛋白酶可能多为游离酶,β-葡萄糖苷酶及几丁质酶多为附着酶。不同的培养温度对氨肽酶活性产生了一定的影响,但对磷酸酶、几丁质酶与糖苷酶活性影响不大,猜测这也可能与培养温度梯度较小有关。综上所述,不同的培养温度可能会使该菌株的胞外酶活性发生一定变化,但目前还未明确培养温度对该菌株胞外酶活性的具体调控作用。综上所述,研究中国近海和北极海域表层海水中细菌多样性和海洋胞外酶活性及影响因素,不仅可以开发利用微生物及酶资源,同时可以增强对海洋有机物循环过程的理解。
其他文献
在人群聚集的场馆进行安全疏散需要应对许多挑战,如果引导不当,容易造成踩踏事件,造成重大人员伤亡。针对疏散中的人群动态变化,设计高效、合理的疏散策略引导行人有序疏散,能够有效降低风险,对人群安全管理具有重大意义。然而,人群疏散受多因素影响,充满不确定性,任何不可预见的突发事件都可能引起人群状态的不稳定,疏散策略应当能够应对环境和人群状态的变化,针对已发生的群体异常提供有效解决方案,防止进一步引发群体
学位
随着传感器的普及和感知技术的不断发展,越来越多的时序数据在连续不断地产生。这些时序数据中蕴含着丰富的信息,能够用于多种场景,例如预测城市中未来空气质量变化、工业监控数据自动风险排查、个性化商品推荐服务以及挖掘潜藏的自然规律等。其中时序相似性搜索作为时序分析的基本算子之一,用于支持以上应用,且这些应用普遍对其拥有较高的时效性要求。然而大数据时代的来临使得时序数据具有基数大、维度高且不断产生的特点,想
学位
隐私保护集合交集(Private Set Intersection,PSI)是一种重要的密码协议,有许多实际应用。随着云计算能力的增强,人们希望利用云存储私有数据集并将PSI计算委托给它。随着个人消费需求的智能化,位置信息日益彰显其重要性,安全的位置验证必不可少。尽管已存在一些高效的PSI协议,但没有一个协议同时支持数据外包、距离限定和区域限定。然而,设计可靠高效的数据外包隐私保护集合交集协议,仍
学位
Android应用程序引入恶意或存在漏洞的第三方库是Android应用程序演化过程中长期存在的严重安全问题。为检测Android应用程序中的第三方库及具体的版本信息,对应用程序进行静态分析和相似度匹配是一种常见的有效手段。商用Android应用程序通常运用多种混淆技术以防止逆向分析,包括基本的标识符重命名、死代码消除以及其他高级混淆技术(如类重打包、控制流随机化等),给第三方库的准确检测造成极大困
学位
减数分裂是真核生物有性生殖的必要环节,需要经过一次DNA复制和两次染色体分离,最终产生染色体数目减半的配子。减数分裂过程中,在同源染色体间发生配对、重组、联会等一系列复杂而有序的事件。交叉重组是减数分裂的核心事件,是同源染色体正确分离所必需的,也是引起物种遗传多样性的重要源泉。核小体是染色体的基本结构单位,由组蛋白和DNA构成。在核小体结构中,组蛋白的氮末端会延伸到组蛋白八聚体构成的核心组分之外,
学位
尼古丁是烟草植物中主要的生物碱,它很容易穿过血脑屏障和生物膜与神经系统中的烟碱乙酰胆碱受体相互作用,引起恶心、心律失常、痉挛等,对人体造成伤害;同时,在卷烟制造过程中产生的大量烟草废弃物会污染水源、土壤,带来严重的环境问题。在研究中发现有些微生物可以利用尼古丁作为碳源和氮源来供给自身生长,利用微生物降解尼古丁可以降低香烟中的尼古丁含量,从而减少吸烟者对烟草的成瘾性;还可以应用于工业生产中烟草废弃物
学位
木质纤维素是地球上储量最丰富的、非粮的、可再生生物质资源,通过生物炼制技术将木质纤维素转化为生物燃料和各种化学原料等高附加值产物是解决资源、环境问题的途径之一。本论文以构建利用木质纤维素生物质生产高值产物酪醇的生物炼制工艺为主线,分别对改善纤维素的糖化效率,优化产酪醇酵母菌株发酵工艺进行了主要研究,并且对同步糖化发酵生产酪醇的新工艺以及将酪醇转化为羟基酪醇的全细胞转化进行了初步探索。首先,为了提高
学位
近年来机器学习技术发展迅猛,已被广泛应用于金融、医疗和自动化等多个领域。随着手机等智能设备的日益普及,数据作为支撑机器学习发展的关键驱动力,其分布逐渐趋向于本地化,而不再由大型数据中心统一进行存储。仅在规模有限的本地数据上训练会导致模型过拟合,但出于数据的隐私考虑,设备所有者通常不愿意将带有敏感信息的本地数据直接共享给他人,从而形成“数据孤岛”问题。联邦学习(Federated learning,
学位
随着人工智能技术的快速发展,各种智能服务在现实生活中被广泛应用。传统机器学习场景中通常会搜集、存储多方的数据,用以分析、提取潜在信息。但随着人们对自身数据隐私的日益关注以及各种数据隐私法案的提出,如何在保护数据安全、隐私的前提下合理地挖掘、利用数据知识愈加受到关注。作为一种新兴的分布式机器学习方案,联邦学习能够在保护用户数据隐私的同时使得大量客户端设备协同训练机器学习模型,参与客户端均能从其中获益
学位
云存储是以云计算技术为依托,采取按需付费的服务方式,为用户提供强大的计算资源以及无限的存储空间。用户只需要使用轻量级的设备连接网络,就可以随时随地访问外包数据,而无需花费高额的成本在本地软硬件系统的维护上。然而,云存储在为用户带来便捷的同时,它也带来了许多安全隐患。首先,由于云服务器的不完全可信性,用户需要授权审计者帮助其周期性地检查云存储数据的完整性。当审计者不可用或者行为不端时,用户需要撤销该
学位