甜瓜（Cucumis melo L.）生产中已广泛使用杂交种,但杂交率低的种子和假冒的杂交种子会给生产带来极大危害。目前鉴定甜瓜杂交种子纯度主要依靠田间种植检测法（Grow-out Test）,用这种方法不仅占用土地,费时费工,且易受自然灾害影响,致使检测失败,耽误农时。本研究应用SSR标记技术对12个甜瓜杂交品种（系）的种子及其亲本共16份材料进行了分析,建立了杂交甜瓜品种的SSR指纹图谱和指纹技术鉴定甜瓜杂交种的标准参照程序,对几份商品杂交甜瓜进行了纯度分析,并探讨了SSR标记技术在生产上的适应性及应用前景。主要研究结果如下: 1、SSR扩增反应体系的建立:反应体系（25μl）中含有10×PCR buffer 2.5μL,2.5mM dNTPs 2.0μL,MgCl₂（25mM）2.0μL,3U TaqE,SSR上、下游引物（5pmol/μL）各1μL,100ng模板DNA。SSR扩增热循环参数为:94℃预变性3min,然后94℃变性30sec,51～54℃退火30sec,72℃延伸1min,共34个循环,最后72℃延伸5min。 2、SSR指纹图谱的构建:从37对SSR引物中筛选出10对扩增产物具有稳定多态性的引物,这些引物分布在甜瓜整个基因组,每对引物可以检测到2～4个数目不等的多态性片段（allele）,共27个多态性片段,平均为2.7个,片段大小介于85～270bp之间,并从入选的10对SSR引物中选出7对构建了甜瓜杂交种及其亲本的SSR指纹图谱。在比较分析各试材图谱的基础上,探讨了品种指纹图谱的统计学方法,并对构建的指纹图谱进行了可信度分析。 3、甜瓜杂种纯度的真实性鉴定及其应用:以‘东方蜜1号’和‘01-31’及其亲本为材料,利用SSR分子标记技术研究杂交种与其双亲之间的扩增谱带多态性,以甄别真假杂种。所试验的37对SSR引物中有7对引物在‘东方蜜1号’及其双亲之间存在扩增多态性,有5对引物在‘01-31’及其双亲之间存在扩增多态性,表现为:多数SSR引物对自交系的扩增只出现1条带,但部分引物在某些自交系中扩增出2条带,杂交种条带均为父母本的互补型,很适合做杂交种纯度鉴定,用引物PM₆对‘东方蜜1号’和引物PM₁₇对‘01-31’进行了各100粒单种子SSR鉴定,所测纯度分别为98%和99%,与田间纯度98.4%和99.2%非常接近,我们又用引物PM₁₆和引物PM₁₈分别对‘东方蜜1号’和‘01-31’再次进行室内纯度检验,得到了同样的结果,说明用SSR标记技术检测甜瓜杂种纯度是完全可行的。