HIV-P24核酸适配体的筛选及鉴定

来源 :兰州理工大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:mu_322
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核酸适配体是通过体外SELEX技术所筛选到的一类单链寡核苷酸分子,一般为数十个到上百个碱基的核苷酸单链,它可经过碱基配对折叠形成凸环、发卡、假节、G-四分体等三级结构,通过形状匹配、氢键、范德华力等方式识别靶分子。适配体因为具有识别目标范围广泛,易修饰改造,制备方便等优点,在疾病的标志物诊断,体内成像,临床治疗等方面具有巨大的应用前景。  成熟的HIV病毒颗粒由三个部分组成,核心遗传物质RNA,外围包裹的蛋白质核衣壳,及最外层的包膜。P24蛋白为I型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)的核心抗原,由P24蛋白组成的上千个衣壳微粒,形成了牢固包裹病毒核心的锥状外壳,而且外壳仅由P24蛋白组成,由于编码P24蛋白的核酸序列在不同HIV毒株之间呈现高度保守性,因此P24蛋白可被用于HIV病毒的检测。ELISA方法为临床上P24蛋白的基本检测方法,但在检测灵敏度和特异性方面均有不足。本实验研究应用SELEX技术用于筛选P24蛋白的特异性核酸适配体,为临床检测和疾病治疗提供一种准确可靠的技术手段。  本实验采用混合硝酸纤维素酯膜作为HIV-P24蛋白吸附介质,以P24蛋白为目标靶,采用靶标消减SELEX方案,从寡核苷酸文库中筛选得到P24蛋白的特异寡核苷酸分子,在实验中,探索了合适的封闭液成分和封闭条件,经过筛选,将筛选得到的寡核苷酸次级文库连接PMD18-T质粒载体,导入大肠杆菌DH5α.感受态细胞,得到单克隆后采用交错PCR的方法鉴定阳性克隆,并确定序列插入方向,以不对称PCR方法制备生物素标记的ssDNA,对核酸适配体进行鉴定,通过测序后分析适配体的二级结构。  通过实验研究,确定了理想的封闭液和封闭条件,经过12轮筛选以及电泳检测使结合P24蛋白的寡核苷酸核酸适配体得到富集。经过酶切、转化后,对得到的172个克隆进行适配体酶联斑点杂交鉴定,得到与P24蛋白有特异性结合的适配体25条,在鉴定过程中,使用了三种鉴定方法,并且发现使用实时荧光定量PCR的鉴定手段具有准确可靠等优点,对测序后的序列进行分析,得出适配体结构以茎环为主。实验成功筛选到了P24蛋白的特异核酸适配体,对其他靶分子特异适配体的筛选具有借鉴意义,为核酸适配体尽快用于临床检测奠定了基础。
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