鸡Ex-FABP基因单核苷酸多态性及其与脂肪性状的相关研究

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本研究以清远麻鸡、封开杏花鸡、惠阳三黄胡须鸡、广西霞烟鸡四个地方品种和岭南黄鸡矮小型麻羽专门化品系、岭南黄快大Ⅱ号配套系商品代、AA白羽商品代肉鸡这3个品系共7个品种(品系)作为试验材料。每个品种(品系)各随机抽取18个个体,其中公母各半。设计了7对引物,通过PCR-SSCP方法在试验群体中对鸡Ex-FABP(Extra-cellular Fatty Acid-Binding Protein,Ex-FABP)基因的5’端调控区以及该基因的外显子4进行了多态性筛选。对SSCP分析结果中的每种纯合子基因型各取2个样品送上海英骏测序公司进行直接正反向测序,从而进一步确定各多态位点的存在及变异情况。同时,该试验还对各多态位点不同基因型与腹脂率、肌内脂肪(Intra-muscular Fat,IMF)含量这两个性状间的关系进行了分析。各阶段的试验结果如下: 7对引物的PCR扩增产物均为条带单一、清晰且特异性很强的目的片段。 引物P1、引物P2、引物P3和引物P7的PCR产物在所选的七个鸡品种(品系)中均检测到三种基因型(AA,BB和AB)。引物P2扩增产物的SSCP分析结果表明:AA白羽商品代肉鸡中未检测到AA基因型的存在,其他的6个品种(品系)中均同时检测到三种基因型的存在;所选的7个品种(品系)中均以纯合子BB基因型居多。 引物P3扩增产物的SSCP分析结果表明:岭南黄快大Ⅱ号配套系、惠阳三黄胡须鸡和封开杏花鸡中只检测到杂合子AB基因型;广西霞烟鸡中只检测到了AA和AB这两种基因型;AA白羽商品代肉鸡、岭南黄鸡矮小型麻羽专门化品系和清远麻鸡中同时检测到三种基因型的存在,而且在岭南黄鸡矮小型麻羽专门化品系和清远麻鸡中这三种基因型的分布情况是完全相同的。 引物P7扩增产物的SSCP分析结果表明:每个品种(品系)中均同时检测到三种基因型的存在;杂合子AB基因型在岭南黄快大Ⅱ号配套系、惠阳三黄胡须鸡、清远麻鸡、广西霞烟鸡和封开杏花鸡中居多。 引物P5扩增产物在所选的7个品种(品系)中检测到四种不同的带型(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ和Ⅳ),其中带型Ⅲ未在岭南黄快大Ⅱ号配套系、惠阳三黄胡须鸡和清远麻鸡三个品种中检测到;带型Ⅳ未在惠阳三黄胡须鸡、广西霞烟鸡和封开杏花鸡中检测到。所选的7个品种(品系)中只有AA白羽商品代肉鸡和岭南黄鸡矮小型麻羽专门化品系中同时检测到四种带型的存在。
其他文献
于2004年春季(4-5月)、夏季(7-8月)和秋季(10-11月),对青海海西地区土壤-牧草-绵羊生态系统中三种常量元素(氮、硫、镁)和五种微量元素(铜、锰、锌、硒、钼)的季节变化和盈缺