科技的进步带动了司法鉴定技术的快速发展,通过对刑事案件中涉及的专门性问题进行鉴定,进而依据鉴定意见对案件进行裁判,已经成为当今刑事裁判的重要路径。但任何事物都具有两面性,鉴定意见虽然在刑事司法领域纠正错案过程中起到了积极作用,但过分依赖鉴定意见也会面临极大的风险。随着利用鉴定意见作为定案依据的案件数量上升,因鉴定意见出现各种问题形成错案的数量也逐渐增加。采用实证研究方法,通过裁判文书网检索和媒体报道确定经过再审程序后改判无罪的判例共计41件,包含“再”字号案件29件、启动再审程序后“初”字号案件5件和启动再审程序后“终”字号案件7件。以41件判例为研究对象,经过对41个研究对象的梳理,整理出每个错案中鉴定意见出现的具体问题,并根据这些细致化的问题归纳提出在鉴定活动前,裁判人员对鉴定机构人员资质审核不清、鉴定活动中证据保管链体系不完整、鉴定人员在鉴定过程中出现各种技术偏差、法官专业限制导致对鉴定意见的误用、司法机关依职权纠正错案的作用有限等问题,为文章探讨错案中鉴定意见的排除与运用打下基础。在讨论错案鉴定意见的排除与运用问题时从证据属性入手,将证据在法庭中可采的标准划分为采纳标准和采信标准,并且在采纳阶段和采信阶段又细致划分为关联性、合法性、真实性和可靠性。鉴定意见是运用科学技术和知识得到的判断意见,也应当具有科学证据的可靠性,并将其放入证据的采信标准进行分析讨论。其中符合证据采纳标准、采信标准的鉴定意见就探讨其在案件中的运用,不符合以上标准的就将其予以排除。进而探讨鉴定意见是予以保留抑或是将其排除在证据之外就分析其是否符合证据的关联性、合法性、真实性以及可靠性。最后,在前段提出问题的基础上提出减少鉴定意见出现差错的改进措施。期望通过加强对鉴定机构和鉴定人的管理考核以保证鉴定意见具有相应的公信力;建立证据保管链体系确保证据自收集、保管、鉴定至质证都是原始状态,不会影响鉴定活动的进行,落实个人责任制有助于追责;鉴定人员和侦查人员在收集和鉴定过程中出现的偏差,可以采用构建严格隔离侦查和鉴定活动来弥补;鉴定人的技术偏差通过加强业务学习、同行评议、完善法律法规和加强法律法规的学习来改进;司法机关不能只追诉犯罪也应当充分发挥保护人权的作用,加强对案件的监督,发现和纠正错案。论文以张玉环案件为例,采用贝叶斯定理及分析模型,探讨了各种假设条件下出现的结果,旨在说明尽管错案在理论上属于小概率事件不可避免,但只要做好了必要的措施,就能做到减少形成错案的风险,降低错案的形成的概率。